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Publications des scientifiques de l'IRD

2018 - Sciences du monde végétal et animal - Articles

  1. Abdalla K., Mutema M., Chivenge P., Everson C., Chaplot Vincent. Grassland degradation significantly enhances soil CO2 emission. Catena, 2018, 167, p. 284-292. ISSN 0341-8162

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  2. Agbidinoukoun A., Doussoh A., Soussou Dangou J., Ahanhanzo C., Engelmann Florent. Used of encapsulation-dehydration technique for short-term preservation of endangered sweet potato (Ipomoea batatas) cultivars. In Vitro Cellular and Developmental Biology Plant, 2018, 54 (Suppl. 1), p. S40-S41. Quadrennial Congress of the International Association of Plant Biotechnology, 14., Dublin (IRL), 2018/08/19-24. ISSN 1054-5476

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  3. Ait-Mouheb N., Bahri A., Ben Thayer B., Benyahia B., Bourrie G., Cherki B., Condom N., Declercq R., Gunes A., Heran M., Kitir N., Molle B., Patureau D., Pollice A., Rapaport A., Renault P., Riahi K., Romagny Bruno, Sari T., Sinfort C., Steyer J. P., Talozi S., Topcuoglu B., Turan M., Wery N., Yildirim E., Harmand J. The reuse of reclaimed water for irrigation around the Mediterranean Rim : a step towards a more virtuous cycle ?. Regional Environmental Change, 2018, 18 (3), p. 693-705. ISSN 1436-3798

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  4. Alexandre A., Landais A., Vallet-Coulomb C., Piel C., Devidal S., Pauchet S., Sonzogni C., Couapel Martine, Pasturel M., Cornuault P., Xin J. M., Mazur J. C., Prie F., Bentaleb I., Webb E., Chalie F., Roy J. The triple oxygen isotope composition of phytoliths as a proxy of continental atmospheric humidity : insights from climate chamber and climate transect calibrations. Biogeosciences, 2018, 15 (10), p. 3223-3241. ISSN 1726-4170

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  5. Alvarez-Flores R., Anh N. T. T., Peredo-Parada S., Joffre R., Winkel Thierry. Rooting plasticity in wild and cultivated Andean Chenopodium species under soil water deficit. Plant and Soil, 2018, 425 (1-2), p. 479-492. ISSN 0032-079X

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  6. Amazirh A., Merlin Olivier, Er-Raki S., Gao Q., Rivalland V., Malbeteau Y., Khabba S., Escorihuela M. J. Retrieving surface soil moisture at high spatio-temporal resolution from a synergy between Sentinel-1 radar and Landsat thermal data : a study case over bare soil. Remote Sensing of Environment, 2018, 211, p. 321-337. ISSN 0034-4257

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  7. Andreote A. P. D., Dini-Andreote F., Rigonato J., Machineski G. S., Souza B. C. E., Barbiéro Laurent, Rezende A. T., Fiore M. F. Contrasting the genetic patterns of microbial communities in Soda lakes with and without cyanobacterial bloom. Frontiers in Microbiology, 2018, 9, p. art. 244 [13 p.]. ISSN 1664-302X

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  8. Andrieu J.M., Lu Wei Louis. A 30-year journey of trial and error towards a tolerogenic AIDS vaccine. In : Skern T. (ed.) In honor of Marc van Regenmortel. Archives of Virology, 2018, 163 (8), p. 2025-2031. ISSN 0304-8608

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  9. Anthelme Fabien, Lavergne S. Alpine and arctic plant communities : a worldwide perspective. Perspectives in Plant Ecology Evolution and Systematics, 2018, 30 (SI), p. 1-5. ISSN 1433-8319

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  10. Arguedas M., Gomez D., Hernandez L., Engelmann Florent, Garramone R., Cejas I., Yabor L., Martinez-Montero M. E., Lorenzo J. C. Maize seed cryo-storage modifies chlorophyll, carotenoid, protein, aldehyde and phenolics levels during early stages of germination. Acta Physiologiae Plantarum, 2018, 40 (6), p. art. 118 [9p.]. ISSN 0137-5881

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  11. Assoumane A., Blay C., Sanda A. K. A., Mariac Cédric, Pham Jean-Louis, Bezançon Gilles, Vigouroux Yves. Wild crop relative populations hot-spots of diversity are hot-spots of introgression in the case of pearl millet. Genetic Resources and Crop Evolution, 2018, 65 (4), p. 1187-1194. ISSN 0925-9864

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  12. Aubert M., Trap Jean, Chauvat M., Hedde M., Bureau F. Forest humus forms as a playground for studying aboveground-belowground relationships. Part 2 : a case study along the dynamics of a broadleaved plain forest ecosystem. In : Zanella A. (ed.), Ascher-Junell J. (ed.) Humusica 3 : reviews, applications, tools. Applied Soil Ecology, 2018, 123 (No spécial), p. 398-408. ISSN 0929-1393

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  13. Azim K., Faissal Y., Soudi B., Perissol C., Roussos Sevastianos, Alami I. T. Elucidation of functional chemical groups responsible of compost phytotoxicity using solid-state C-13 NMR spectroscopy under different initial C/N ratios. Environmental Science and Pollution Research, 2018, 25 (4), p. 3408-3422. ISSN 0944-1344

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  14. Badshah H., Ullah F., Calatayud Paul-André, Ullah H., Ahmad B. Influence of the host plant on the encyrtid Aenasius bambawalei, a parasitoid used to control the cotton mealybug, Phenacoccus solenopsis, in Pakistan. Pakistan Journal of Zoology, 2018, 50 (1), p. 207-216. ISSN 0030-9923

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  15. Barbraud C., Bertrand Arnaud, Bouchon M., Chaigneau Alexis, Delord K., Demarcq Hervé, Gimenez O., Torero M. G., Gutierrez D., Oliveros-Ramos R., Passuni G., Tremblay Yann, Bertrand Sophie. Density dependence, prey accessibility and prey depletion by fisheries drive Peruvian seabird population dynamics. Ecography, 2018, 41 (7), p. 1092-1102. ISSN 0906-7590

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  16. Barot Sébastien. Can we predict the long-term impact of earthworms on plant successions ?. Functional Ecology, 2018, 32 (3), p. 596-598. ISSN 0269-8463

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  17. Barrios E., Valencia V., Jonsson M., Brauman Alain, Hairiah K., Mortimer P.E., Okubo S. Contribution of trees to the conservation of biodiversity and ecosystem services in agricultural landscapes. International Journal of Biodiversity Science, Ecosystems Services and Management, 2018, 14 (1), p. 1-16. ISSN 2151-3732

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  18. Baveye P. C., Otten W., Kravchenko A., Balseiro-Romero M., Beckers E., Chalhoub M., Darnault C., Eickhorst T., Garnier P., Hapca S., Kiranyaz S., Monga Olivier, Mueller C. W., Nunan N., Pot V., Schluter S., Schmidt H., Vogel H. J. Emergent properties of microbial activity in heterogeneous soil microenvironments : different research approaches are slowly converging, yet major challenges remain. Frontiers in Microbiology, 2018, 9, p. art. 1929 [48 p.]. ISSN 1664-302X

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  19. Belhadi D., Lajudie Philippe de, Ramdani N., Le Roux C., Boulila F., Tisseyre Pierre, Boulila A., Benguedouar A., Kaci Y., Laguerre G. Vicia faba L. in the Bejaia region of Algeria is nodulated by Rhizobium leguminosarum sv. viciae, Rhizobium laguerreae and two new genospecies. Systematic and Applied Microbiology, 2018, 41 (2), p. 122-130. ISSN 0723-2020

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  20. Belhadj-Khedher C., Koutsias N., Karamitsou A., Ei-Melki T., Ouelhazi B., Hamdi A., Nouri H., Mouillot Florent. A revised historical fire regime analysis in Tunisia (1985-2010) from a critical analysis of the national fire database and remote sensing. Forests, 2018, 9 (2), p. art. 59 [25 p.]. ISSN 1999-4907

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  21. Belin B. J., Busset N., Giraud Eric, Molinaro A., Silipo A., Newman D. K. Hopanoid lipids : from membranes to plant-bacteria interactions. Nature Reviews Microbiology, 2018, 16 (5), p. 304-315. ISSN 1740-1526

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  22. Bellakanji A. C., Zribi M., Lili-Chabaane Z., Mougenot Bernard. Forecasting of cereal yields in a semi-arid area using the Simple Algorithm for Yield Estimation (SAFY) agro-meteorological model combined with optical SPOT/HRV images. Sensors, 2018, 18 (7), p. art. 2138 [19 p.]. ISSN 1424-8220

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  23. Ben Abdallah M., Karray F., Kallel N., Armougom Fabrice, Mhiri N., Quéméneur Marianne, Cayol J. L., Erauso G., Sayadi S. Abundance and diversity of prokaryotes in ephemeral hypersaline lake Chott El Jerid using Illumina Miseq sequencing, DGGE and qPCR assays. Extremophiles, 2018, 22 (5), p. 811-823. ISSN 1431-0651

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  24. Ben Ouada S., Ben Ali R., Leboulanger Christophe, Zaghden H., Choura S., Ben Ouada H., Sayadi S. Effect and removal of bisphenol A by two extremophilic microalgal strains (Chlorophyta). Journal of Applied Phycology, 2018, 30 (3), p. 1765-1776. ISSN 0921-8971

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  25. Benavides M., Shoemaker K. M., Moisander P. H., Niggemann J., Dittmar T., Duhamel S., Grosso O., Pujo-Pay M., Helias-Nunige S., Fumenia A., Bonnet Sophie. Aphotic N-2 fixation along an oligotrophic to ultraoligotrophic transect in the western tropical South Pacific Ocean. Biogeosciences, 2018, 15 (9), p. 3107-3119. ISSN 1726-4170

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  26. Benjamin J. M., Chippaux Jean-Philippe, Sambo B. T., Massougbodji A. Delayed double reading of whole blood clotting test (WBCT) results at 20 and 30 minutes enhances diagnosis and treatment of viper envenomation. Journal of Venomous Animals and Toxins Including Tropical Diseases, 2018, 24, p. art. 14 [12 p.]. ISSN 1678-9199

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  27. Bettarel Yvan, Combe Marine, Adingra A., Ndiaye A., Bouvier T., Panfili Jacques, Durand Jean-Dominique. Hordes of phages in the gut of the Tilapia Sarotherodon melanotheron. Scientific Reports - Nature, 2018, 8, p. art. 11311 [6 p.]. ISSN 2045-2322

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  28. Beulé T., Ilbert P., Adeoti K., Durand-Gasselin T., Dumet Dominique, Engelmann Florent, Morcillo F. Recovery of oil palm (Elaeis guineensis Jacq.) somatic embryos cryostored for 20 years. Cryoletters, 2018, 39 (1), p. 60-66. ISSN 0143-2044

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  29. Bezrutczyk M., Yang J. I., Eom J. S., Prior M., Sosso D., Hartwig T., Szurek Boris, Oliva R., Vera-Cruz C., White F. F., Yang B., Frommer W. B. Sugar flux and signaling in plant-microbe interactions. Plant Journal, 2018, 93 (4), p. 675-685. ISSN 0960-7412

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  30. Bonato Olivier, Chadoeuf J. Arthropods life cycle and temperature : beyond isomorphy hypothesis. Journal of Thermal Biology, 2018, 75, p. 1-6. ISSN 0306-4565

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  31. Borg J., Kiaer L. P., Lecarpentier C., Goldringer I., Gauffreteau A., Saint-Jean S., Barot Sébastien, Enjalbert J. Unfolding the potential of wheat cultivar mixtures : a meta-analysis perspective and identification of knowledge gaps. Field Crops Research, 2018, 221, p. 298-313. ISSN 0378-4290

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  32. Bossa-Castro A. M., Tekete C., Raghavan C., Delorean E. E., Dereeper Alexis, Dagno K., Koita O., Mosquera G., Leung H., Verdier Valérie, Leach J. E. Allelic variation for broad-spectrum resistance and susceptibility to bacterial pathogens identified in a rice MAGIC population. Plant Biotechnology Journal, 2018, 16 (9), p. 1559-1568. ISSN 1467-7644

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  33. Bouchet S., Goni-Urriza M., Monperrus M., Guyoneaud R., Fernandez P., Heredia C., Tessier E., Gassie C., Point David, Guédron Stéphane, Acha D., Amouroux D. Linking microbial activities and low-molecular-weight thiols to hg methylation in biofilms and periphyton from high-altitude tropical lakes in the Bolivian altiplano. Environmental Science and Technology, 2018, 52 (17), p. 9758-9767. ISSN 0013-936X

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  34. Boudhina N., Zitouna-Chebbi R., Mekki I., Jacob Frédéric, Ben Mechlia N., Masmoudi M., Prevot L. Evaluating four gap-filling methods for eddy covariance measurements of evapotranspiration over hilly crop fields. Geoscientific Instrumentation Methods and Data Systems, 2018, 7 (2), p. 151-167. ISSN 2193-0856

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  35. Bourgarel M., Pfukenyi D.M., Boué Vanina, Talignani L., Chiweshe N., Diop Fodé, Caron A., Matope G., Missé Dorothée, Liégeois Florian. Circulation of Alphacoronavirus, Betacoronavirus and Paramyxovirus in Hipposideros bat species in Zimbabwe. Infection, Genetics and Evolution, 2018, 58, p. 253-257. ISSN 1567-1348

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  36. Bourion V., Heulin-Gotty K., Aubert V., Tisseyre Pierre, Chabert-Martinello M., Pervent M., Delaitre C., Vile D., Siol M., Duc G., Brunel B., Burstin J., Lepetit M. Co-inoculation of a pea core-collection with diverse Rhizobial strains shows competitiveness for nodulation and efficiency of nitrogen fixation are distinct traits in the interaction. Frontiers in Plant Science, 2018, 8, p. art. 2249 [ p.]. ISSN 1664-462X

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  37. Bournaud C., James E. K., de Faria S. M., Lebrun Michel, Melkonian R., Duponnois Robin, Tisseyre Pierre, Moulin Lionel, Prin Y. Interdependency of efficient nodulation and arbuscular mycorrhization in Piptadenia gonoacantha, a Brazilian legume tree. Plant Cell and Environment, 2018, 41 (9), p. 2008-2020. ISSN 0140-7791

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  38. Boussès Philippe, Le Goff Gilbert, Robert Vincent. Inventory of the mosquitoes (Diptera : Culicidae) of the islands of southwestern Indian Ocean, Madagascar excluded : a critical review. Annales de la Société Entomologique de France, 2018, 54 (2), p. 89-110. ISSN 0037-9271

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  39. Branchet P., Cadot Emmanuelle, Fenet H., Sebag David, Ngatcha B. N., Borrell-Estupina V., Ngoupayou J. R. N., Kengne I., Braun Jean-Jacques, Gonzalez C. Polar pesticide contamination of an urban and peri-urban tropical watershed affected by agricultural activities (Yaounde, Center Region, Cameroon). Environmental Science and Pollution Research, 2018, 25 (18), p. 17690-17715. ISSN 0944-1344

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  40. Breitler J. C., Dechamp E., Campa Claudine, Rodrigues L. A. Z., Guyot Romain, Marraccini P., Etienne H. CRISPR/Cas9-mediated efficient targeted mutagenesis has the potential to accelerate the domestication of Coffea canephora. Plant Cell Tissue and Organ Culture, 2018, 134 (3), p. 383-394. ISSN 0167-6857

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  41. Brener-Raffalli K., Clerissi C., Vidal-Dupiol J., Adjeroud Mehdi, Bonhomme F., Pratlong M., Aurelle D., Mitta G., Toulza E. Thermal regime and host clade, rather than geography, drive Symbiodinium and bacterial assemblages in the scleractinian coral Pocillopora damicornis sensu lato. Microbiome, 2018, 6, art. no 39 [13 p.] ISSN 2049-2618

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  42. Broadley D. G., Tolley K. A., Conradie W., Wishart S., Trape Jean-François, Burger M., Kusamba C., Zassi-Boulou A. G., Greenbaum E. A phylogeny and genus-level revision of the African file snakes Gonionotophis Boulenger (Squamata : Lamprophiidae). African Journal of Herpetology, 2018, 67 (1), p. 43-60. ISSN 2156-4574

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  43. Brouat Carine, Diagne Christophe Amidi, Ismail K., Aroussi A., Dalecky Ambroise, Ba K., Kane M., Niang Y., Diallo M., Sow A., Galal L., Piry S., Darde M. L., Mercier A. Seroprevalence of Toxoplasma gondii in commensal rodents sampled across Senegal, West Africa. Parasite, 2018, 25, p. art. 32 [6 p.]. ISSN 1252-607X

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  44. Bruy D., Barrabé L., Munzinger Jérôme. Novitates neocaledonicae VII : a new monocaulous species of Bocquillonia (Euphorbiaceae) from New Caledonia. Phytotaxa, 2018, 360 (1), p. 61-68. ISSN 1179-3155

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  45. Brévault T., Ndiaye A., Badine D., Bocar Bal A., Sembène M., Silvie Pierre, Haran J. First records of the fall armyworm, Spodoptera frugiperda (Lepidoptera: Noctuidae), in Senegal. Entomologia Generalis, 2018, 37 (2), p. 129-142. ISSN 0171-8177

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  46. Bugnicourt P., Guitet S., Santos V. F., Blanc L., Sotta E. D., Barbier Nicolas, Couteron Pierre. Using textural analysis for regional landform and landscape mapping, Eastern Guiana Shield. Geomorphology, 2018, 317, p. 23-44. ISSN 0169-555X

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  47. Burgarella Concetta, Cubry Philippe, Kane N. A., Varshney R. K., Mariac Cédric, Liu X., Shi C. C., Thudi M., Couderc Marie, Xu X., Chitikineni A., Scarcelli Nora, Barnaud Adeline, Rhoné Bénédicte, Dupuy C., Francois O., Berthouly Cécile, Vigouroux Yves. A western Sahara centre of domestication inferred from pearl millet genomes. Nature Ecology and Evolution, 2018, 2 (9), p. 1377-1380. ISSN 2397-334X

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  48. Cabasan M. T. N., Kumar A., Bellafiore Stéphane, De Waele D. Reproductive, pathogenic and genotypic characterisation of five Meloidogyne graminicola populations from the Philippines on susceptible and resistant rice varieties. Nematology, 2018, 20 (4), p. 299-318. ISSN 1388-5545

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  49. Cabon A., Mouillot Florent, Lempereur M., Ourcival J. M., Simioni G., Limousin J. M. Thinning increases tree growth by delaying drought-induced growth cessation in a Mediterranean evergreen oak coppice. Forest Ecology and Management, 2018, 409, p. 333-342. ISSN 0378-1127

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  50. Cameron E. K., Martins I. S., Lavelle Patrick, Mathieu J., Tedersoo L., Gottschall F., Guerra C. A., Hines J., Patoine G., Siebert J., Winter M., Cesarz S., Delgado-Baquerizo M., Ferlian O., Fierer N., Kreft H., Lovejoy T. E., Montanarella L., Orgiazzi A., Pereira H. M., Phillips H. R. P., Settele J., Wall D. H., Eisenhauer N. Global gaps in soil biodiversity data. Nature Ecology and Evolution, 2018, 2 (7), p. 1042-1043. ISSN 2397-334X

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  51. Campos Lfas, Andrade A. B., Bertrand Sophie, Efe M. A. Foraging behavior and at-sea distribution of White-Tailed Tropicbirds in tropical ocean. Brazilian Journal of Biology, 2018, 78 (3), p. 556-563. ISSN 1519-6984

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  52. Candal R., Curutchet G. A., Dominguez-Montero L., Macarie Hervé, Poggi-Varaldo H. M., Sastre-Conde I., Vazquez S. C. Environmental biotechnology and engineering : two convergent areas to provide real solutions for a growing world [Editorial]. In : Candal R. (ed.), CurutchetG.A. (ed.), Domínguez-Montero L. (ed.), Macarie Hervé (ed.), Poggi-Varaldo H.M (ed.), Sastre-Conde I. (ed.), Vázquez S. (ed.) Advances in environmental biotechnology and engineering 2016. Environmental Science and Pollution Research, 2018, 25 (22), p. 21267-21271. ISSN 0944-1344

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