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Publications des scientifiques de l'IRD

2018 - Sciences du monde végétal et animal - Articles

  1. Abahous H., Ronchail J., Sifeddine Abdelfettah, Kenny L., Bouchaou L. Trend and change point analyses of annual precipitation in the Souss-Massa Region in Morocco during 1932-2010. Theoretical and Applied Climatology, 2018, 134 (3-4), p. 1153-1163. ISSN 0177-798X

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  2. Abdalla K., Mutema M., Chivenge P., Everson C., Chaplot Vincent. Grassland degradation significantly enhances soil CO2 emission. Catena, 2018, 167, p. 284-292. ISSN 0341-8162

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  3. Adego A. K., Poulicard Nils, Galzi Agnès, Mukoye B., Fargette Denis, Were H. K., Hébrard Eugénie. Full-length genome sequences of recombinant and nonrecombinant sympatric strains of rice yellow mottle virus from Western Kenya. Microbiology Resource Announcements, 2018, 6 (8), p. e01508-17 [2p.]. ISSN 2576-098X

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  4. Agbidinoukoun A., Doussoh A., Soussou Dangou J., Ahanhanzo C., Engelmann Florent. Used of encapsulation-dehydration technique for short-term preservation of endangered sweet potato (Ipomoea batatas) cultivars. In Vitro Cellular and Developmental Biology Plant, 2018, 54 (Suppl. 1), p. S40-S41. Quadrennial Congress of the International Association of Plant Biotechnology, 14., Dublin (IRL), 2018/08/19-24. ISSN 1054-5476

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  5. Aghova T., Kimura Y., Bryja J., Dobigny Gauthier, Granjon Laurent, Kergoat G. J. Fossils know it best : using a new set of fossil calibrations to improve the temporal phylogenetic framework of murid rodents (Rodentia : Muridae). Molecular Phylogenetics and Evolution, 2018, 128, p. 98-111. ISSN 1055-7903

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  6. Aholoukpe H. N. S., Dubos B., Deleporte P., Flori A., Amadji L. G., Chotte Jean-Luc, Blavet Didier. Allometric equations for estimating oil palm stem biomass in the ecological context of Benin, West Africa. Trees : Structure and Function, 2018, 32 (6), p. 1669-1680. ISSN 0931-1890

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  7. Ait-Mouheb N., Bahri A., Ben Thayer B., Benyahia B., Bourrie G., Cherki B., Condom N., Declercq R., Gunes A., Heran M., Kitir N., Molle B., Patureau D., Pollice A., Rapaport A., Renault P., Riahi K., Romagny Bruno, Sari T., Sinfort C., Steyer J. P., Talozi S., Topcuoglu B., Turan M., Wery N., Yildirim E., Harmand J. The reuse of reclaimed water for irrigation around the Mediterranean Rim : a step towards a more virtuous cycle ?. Regional Environmental Change, 2018, 18 (3), p. 693-705. ISSN 1436-3798

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  8. Akhoudas C., Chevalier N., Blanc-Valleron M. M., Klein V., Mendez-Millan Mercedes, Demange J., Dalliah S., Rommevaux V., Boudouma O., Pierre C., Ruffine L. Methane-derived stromatolitic carbonate crust from an active fluid seepage in the western basin of the Sea of Marmara : mineralogical, isotopic and molecular geochemical characterization. Deep-Sea Research Part II :Topical Studies in Oceanography, 2018, 153 (SI), p. 110-120. ISSN 0967-0645

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  9. Alexandre A., Landais A., Vallet-Coulomb C., Piel C., Devidal S., Pauchet S., Sonzogni C., Couapel Martine, Pasturel M., Cornuault P., Xin J. M., Mazur J. C., Prie F., Bentaleb I., Webb E., Chalie F., Roy J. The triple oxygen isotope composition of phytoliths as a proxy of continental atmospheric humidity : insights from climate chamber and climate transect calibrations. Biogeosciences, 2018, 15 (10), p. 3223-3241. ISSN 1726-4170

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  10. Alvarez-Flores R., Anh N. T. T., Peredo-Parada S., Joffre R., Winkel Thierry. Rooting plasticity in wild and cultivated Andean Chenopodium species under soil water deficit. Plant and Soil, 2018, 425 (1-2), p. 479-492. ISSN 0032-079X

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  11. Amazirh A., Merlin Olivier, Er-Raki S., Gao Q., Rivalland V., Malbeteau Y., Khabba S., Escorihuela M. J. Retrieving surface soil moisture at high spatio-temporal resolution from a synergy between Sentinel-1 radar and Landsat thermal data : a study case over bare soil. Remote Sensing of Environment, 2018, 211, p. 321-337. ISSN 0034-4257

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  12. Anderson Gonzaga Masullo Y., Da Costa Gurgel H., Laques Anne-Elisabeth, Silva Carvalho D. Dinâmica socioeconômica das unidades de conservação do Maranhão . Confins, 2018, (38), [21 p. en ligne] ISSN 1958-9212

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  13. Anderson Gonzaga Masullo Y., Da Costa Gurgel H., Laques Anne-Elisabeth, Silva Carvalho D., De Castro E. Indice de controle ambiental das unidades de conservação do Maranhão . Revista do Departamento de Geografia da Universidade de São Paulo, 2018, 36, p. 104-116. ISSN 2236-2878

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  14. Andreote A. P. D., Dini-Andreote F., Rigonato J., Machineski G. S., Souza B. C. E., Barbiéro Laurent, Rezende A. T., Fiore M. F. Contrasting the genetic patterns of microbial communities in Soda lakes with and without cyanobacterial bloom. Frontiers in Microbiology, 2018, 9, p. art. 244 [13 p.]. ISSN 1664-302X

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  15. Andrieu J.M., Lu Wei Louis. A 30-year journey of trial and error towards a tolerogenic AIDS vaccine. In : Skern T. (ed.) In honor of Marc van Regenmortel. Archives of Virology, 2018, 163 (8), p. 2025-2031. ISSN 0304-8608

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  16. Anthelme Fabien, Lavergne S. Alpine and arctic plant communities : a worldwide perspective. Perspectives in Plant Ecology Evolution and Systematics, 2018, 30 (SI), p. 1-5. ISSN 1433-8319

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  17. Arguedas M., Gomez D., Hernandez L., Engelmann Florent, Garramone R., Cejas I., Yabor L., Martinez-Montero M. E., Lorenzo J. C. Maize seed cryo-storage modifies chlorophyll, carotenoid, protein, aldehyde and phenolics levels during early stages of germination. Acta Physiologiae Plantarum, 2018, 40 (6), p. art. 118 [9p.]. ISSN 0137-5881

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  18. Aribi Jamel, Ribière William, Villain L., Anthony François. Screening of wild coffee (coffea spp.) for resistance to meloidogyne incognita race 1. Nematropica, 2018, 48 (1), p. 5-14. ISSN 0099-5444

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  19. Assoumane A., Blay C., Sanda A. K. A., Mariac Cédric, Pham Jean-Louis, Bezançon Gilles, Vigouroux Yves. Wild crop relative populations hot-spots of diversity are hot-spots of introgression in the case of pearl millet. Genetic Resources and Crop Evolution, 2018, 65 (4), p. 1187-1194. ISSN 0925-9864

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  20. Aubert M., Trap Jean, Chauvat M., Hedde M., Bureau F. Forest humus forms as a playground for studying aboveground-belowground relationships. Part 2 : a case study along the dynamics of a broadleaved plain forest ecosystem. In : Zanella A. (ed.), Ascher-Junell J. (ed.) Humusica 3 : reviews, applications, tools. Applied Soil Ecology, 2018, 123 (No spécial), p. 398-408. ISSN 0929-1393

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  21. Azim K., Faissal Y., Soudi B., Perissol C., Roussos Sevastianos, Alami I. T. Elucidation of functional chemical groups responsible of compost phytotoxicity using solid-state C-13 NMR spectroscopy under different initial C/N ratios. Environmental Science and Pollution Research, 2018, 25 (4), p. 3408-3422. ISSN 0944-1344

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  22. Badshah H., Ullah F., Calatayud Paul-André, Ullah H., Ahmad B. Influence of the host plant on the encyrtid Aenasius bambawalei, a parasitoid used to control the cotton mealybug, Phenacoccus solenopsis, in Pakistan. Pakistan Journal of Zoology, 2018, 50 (1), p. 207-216. ISSN 0030-9923

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  23. Barbraud C., Bertrand Arnaud, Bouchon M., Chaigneau Alexis, Delord K., Demarcq Hervé, Gimenez O., Torero M. G., Gutierrez D., Oliveros-Ramos R., Passuni G., Tremblay Yann, Bertrand Sophie. Density dependence, prey accessibility and prey depletion by fisheries drive Peruvian seabird population dynamics. Ecography, 2018, 41 (7), p. 1092-1102. ISSN 0906-7590

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  24. Barot Sébastien. Can we predict the long-term impact of earthworms on plant successions ?. Functional Ecology, 2018, 32 (3), p. 596-598. ISSN 0269-8463

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  25. Barrios E., Valencia V., Jonsson M., Brauman Alain, Hairiah K., Mortimer P.E., Okubo S. Contribution of trees to the conservation of biodiversity and ecosystem services in agricultural landscapes. International Journal of Biodiversity Science, Ecosystems Services and Management, 2018, 14 (1), p. 1-16. ISSN 2151-3732

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  26. Bassene Hubert, Niang E. A., Fenollar F., Dipankar B., Doucouré Souleymane, Ali E., Michelle C., Raoult D., Sokhna Cheikh, Mediannikov Oleg. 16S metagenomic comparison of Plasmodium falciparum-infected and noninfected Anopheles gambiae and Anopheles funestus microbiota from Senegal. American Journal of Tropical Medicine and Hygiene, 2018, 99 (6), p. 1489-1498. ISSN 0002-9637

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  27. Bastin J. F., Rutishauser E., Kellner J. R., Saatchi S., Pélissier Raphaël, Herault B., Slik F., Bogaert J., De Canniere C., Marshall A. R., Poulsen J., Alvarez-Loyayza P., Andrade A., Angbonga-Basia A., Araujo-Murakami A., Arroyo L., Ayyappan N., de Azevedo C. P., Banki O., Barbier Nicolas, Barroso J. G., Beeckman H., Bitariho R., Boeckx P., Boehning-Gaese K., Brandao H., Brearley F. Q., Hockemba M. B. N., Brienen R., Camargo J. L. C., Campos-Arceiz A., Cassart B., Chave J., Chazdon R., Chuyong G., Clark D. B., Clark C. J., Condit R., Coronado E. N. H., Davidar P., de Haulleville T., Descroix L., Doucet J. L., Dourdain A., Droissart Vincent, Duncan T., Espejo J. S., Espinosa S., Farwig N., Fayolle A., Feldpausch T. R., Ferraz A., Fletcher C., Gajapersad K., Gillet J. F., do Amaral I. L., Gonmadje C., Grogan J., Harris D., Herzog S. K., Homeier J., Hubau W., Hubbell S. P., Hufkens K., Hurtado J., Kamdem N. G., Kearsley E., Kenfack D., Kessler M., Labriere N., Laumonier Y., Laurance S., Laurance W. F., Lewis S. L., Libalah M. B., Ligot G., Lloyd J., Lovejoy T. E., Malhi Y., Marimon B. S., Marimon B., Martin E. H., Matius P., Meyer V., Bautista C. M., Monteagudo-Mendoza A., Mtui A., Neill D., Gutierrez G. A. P., Pardo G., Parren M., Parthasarathy N., Phillips O. L., Pitman N. C. A., Ploton Pierre, Ponette Q., Ramesh B. R., Razafimahaimodison J. C., Réjou-Méchain Maxime, Rolim S. G., Saltos H. R., Rossi L. M. B., Spironello W. R., Rovero F., Saner P., Sasaki D., Schulze M., Silveira M., Singh J., Sist P., Sonke B., Soto J. D., de Souza C. R., Stropp J., Sullivan M. J. P., Swanepoel B., ter Steege H., Terborgh J., Texier Nicolas, Toma T., Valencia R., Valenzuela L., Ferreira L. V., Valverde F. C., Van Andel T. R., Vasque R., Verbeeck H., Vivek P., Vleminckx J., Vos V. A., Wagner F. H., Puspa W. P., Wortel V., Zagt R. J., Zebaze D. Pan-tropical prediction of forest structure from the largest trees. Global Ecology and Biogeography, 2018, 27 (11), p. 1366-1383. ISSN 1466-822X

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  28. Baveye P. C., Otten W., Kravchenko A., Balseiro-Romero M., Beckers E., Chalhoub M., Darnault C., Eickhorst T., Garnier P., Hapca S., Kiranyaz S., Monga Olivier, Mueller C. W., Nunan N., Pot V., Schluter S., Schmidt H., Vogel H. J. Emergent properties of microbial activity in heterogeneous soil microenvironments : different research approaches are slowly converging, yet major challenges remain. Frontiers in Microbiology, 2018, 9, p. art. 1929 [48 p.]. ISSN 1664-302X

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  29. Belahbib H., Summers Z. M., Fardeau Marie-Laure, Joseph Manon, Tamburini C., Dolla A., Ollivier Bernard, Armougom Fabrice. Towards a congruent reclassification and nomenclature of the thermophilic species of the genus Pseudothermotoga within the order Thermotogales. Systematic and Applied Microbiology, 2018, 41 (6), p. 555-563. ISSN 0723-2020

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  30. Belhadi D., Lajudie Philippe de, Ramdani N., Le Roux C., Boulila F., Tisseyre Pierre, Boulila A., Benguedouar A., Kaci Y., Laguerre G. Vicia faba L. in the Bejaia region of Algeria is nodulated by Rhizobium leguminosarum sv. viciae, Rhizobium laguerreae and two new genospecies. Systematic and Applied Microbiology, 2018, 41 (2), p. 122-130. ISSN 0723-2020

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  31. Belhadj-Khedher C., Koutsias N., Karamitsou A., Ei-Melki T., Ouelhazi B., Hamdi A., Nouri H., Mouillot Florent. A revised historical fire regime analysis in Tunisia (1985-2010) from a critical analysis of the national fire database and remote sensing. Forests, 2018, 9 (2), p. art. 59 [25 p.]. ISSN 1999-4907

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  32. Belin B. J., Busset N., Giraud Eric, Molinaro A., Silipo A., Newman D. K. Hopanoid lipids : from membranes to plant-bacteria interactions. Nature Reviews Microbiology, 2018, 16 (5), p. 304-315. ISSN 1740-1526

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  33. Bellakanji A. C., Zribi M., Lili-Chabaane Z., Mougenot Bernard. Forecasting of cereal yields in a semi-arid area using the Simple Algorithm for Yield Estimation (SAFY) agro-meteorological model combined with optical SPOT/HRV images. Sensors, 2018, 18 (7), p. art. 2138 [19 p.]. ISSN 1424-8220

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  34. Ben Abdallah M., Karray F., Kallel N., Armougom Fabrice, Mhiri N., Quéméneur Marianne, Cayol J. L., Erauso G., Sayadi S. Abundance and diversity of prokaryotes in ephemeral hypersaline lake Chott El Jerid using Illumina Miseq sequencing, DGGE and qPCR assays. Extremophiles, 2018, 22 (5), p. 811-823. ISSN 1431-0651

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  35. Ben Khalfallah C., Delaître Eric, Ouerchefani D., Demagistri Laurent, Allouche F. K., Darragi F., Seyler Frédérique. Monitoring vegetation dynamics in southern Tunisia using SPOT-5 (Take5) data : a case study of the Tozeur oases. Journal of Applied Remote Sensing, 2018, 12 (4), p. art. 046002 [14 p.]. ISSN 1931-3195

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  36. Ben Ouada S., Ben Ali R., Leboulanger Christophe, Zaghden H., Choura S., Ben Ouada H., Sayadi S. Effect and removal of bisphenol A by two extremophilic microalgal strains (Chlorophyta). Journal of Applied Phycology, 2018, 30 (3), p. 1765-1776. ISSN 0921-8971

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  37. Benavides M., Shoemaker K. M., Moisander P. H., Niggemann J., Dittmar T., Duhamel S., Grosso O., Pujo-Pay M., Helias-Nunige S., Fumenia A., Bonnet Sophie. Aphotic N-2 fixation along an oligotrophic to ultraoligotrophic transect in the western tropical South Pacific Ocean. Biogeosciences, 2018, 15 (9), p. 3107-3119. ISSN 1726-4170

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  38. Benjamin J. M., Chippaux Jean-Philippe, Sambo B. T., Massougbodji A. Delayed double reading of whole blood clotting test (WBCT) results at 20 and 30 minutes enhances diagnosis and treatment of viper envenomation. Journal of Venomous Animals and Toxins Including Tropical Diseases, 2018, 24, p. art. 14 [12 p.]. ISSN 1678-9199

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  39. Bettarel Yvan, Combe Marine, Adingra A., Ndiaye A., Bouvier T., Panfili Jacques, Durand Jean-Dominique. Hordes of phages in the gut of the Tilapia Sarotherodon melanotheron. Scientific Reports - Nature, 2018, 8, p. art. 11311 [6 p.]. ISSN 2045-2322

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  40. Beulé T., Ilbert P., Adeoti K., Durand-Gasselin T., Dumet Dominique, Engelmann Florent, Morcillo F. Recovery of oil palm (Elaeis guineensis Jacq.) somatic embryos cryostored for 20 years. Cryoletters, 2018, 39 (1), p. 60-66. ISSN 0143-2044

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010072711 Accès réservé (Intranet IRD)

  41. Bezrutczyk M., Yang J. I., Eom J. S., Prior M., Sosso D., Hartwig T., Szurek Boris, Oliva R., Vera-Cruz C., White F. F., Yang B., Frommer W. B. Sugar flux and signaling in plant-microbe interactions. Plant Journal, 2018, 93 (4), p. 675-685. ISSN 0960-7412

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010072071 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  42. Bichang'a G., Da Lage J. L., Capdevielle Dulac Claire, Zivy M., Balliau T., Sambai K., Le Rü Bruno, Kaiser L., Juma G., Maina E. N. M., Calatayud Paul-André. Alpha-amylase mediates host acceptance in the Braconid parasitoid Cotesia flavipes. Journal of Chemical Ecology, 2018, 44 (11), p. 1030-1039. ISSN 0098-0331

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  43. Bonato Olivier, Chadoeuf J. Arthropods life cycle and temperature : beyond isomorphy hypothesis. Journal of Thermal Biology, 2018, 75, p. 1-6. ISSN 0306-4565

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010073673 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  44. Borg J., Kiaer L. P., Lecarpentier C., Goldringer I., Gauffreteau A., Saint-Jean S., Barot Sébastien, Enjalbert J. Unfolding the potential of wheat cultivar mixtures : a meta-analysis perspective and identification of knowledge gaps. Field Crops Research, 2018, 221, p. 298-313. ISSN 0378-4290

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010072775 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  45. Bossa-Castro A. M., Tekete C., Raghavan C., Delorean E. E., Dereeper Alexis, Dagno K., Koita O., Mosquera G., Leung H., Verdier Valérie, Leach J. E. Allelic variation for broad-spectrum resistance and susceptibility to bacterial pathogens identified in a rice MAGIC population. Plant Biotechnology Journal, 2018, 16 (9), p. 1559-1568. ISSN 1467-7644

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  46. Bossa-Castro A. M., Tekete C., Raghavan C., Delorean E., Dereeper Alexis, Verdier Valérie, Dagno K., Koita O., Mosquera G. M., Leung H., Leach J. E. Broad-spectrum resistance and susceptibility to bacterial blight and bacterial leaf streak of rice. Phytopathology, 2018, 108 (10), p. 172-172. ICPP.International Congress of Plant Pathology, Boston (USA), 2018/07/29-2018/08/03. ISSN 0031-949X

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  47. Bouam A., Levasseur A., Bonnet Maryline, Borand L., Van Goethem C., Drancourt M., Godreuil S. Complete genome sequence of Mycobacterium sp. Strain 3519A. Microbiology Resource Announcements, 2018, 6 (4), p. e01565-17 [2 p.]. ISSN 2576-098X

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  48. Bouam A., Levasseur A., Bonnet Maryline, Borand L., Van Goethem C., Drancourt M., Godreuil S. Complete genome sequence of Mycobacterium sp. Strain 4858. Microbiology Resource Announcements, 2018, 6 (7), p. e01604-17 [2 p.]. ISSN 2576-098X

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  49. Bouchet S., Goni-Urriza M., Monperrus M., Guyoneaud R., Fernandez P., Heredia C., Tessier E., Gassie C., Point David, Guédron Stéphane, Acha D., Amouroux D. Linking microbial activities and low-molecular-weight thiols to hg methylation in biofilms and periphyton from high-altitude tropical lakes in the Bolivian altiplano. Environmental Science and Technology, 2018, 52 (17), p. 9758-9767. ISSN 0013-936X

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