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Publications des scientifiques de l'IRD

2018 - Océanographie / Hydrobiologie

  1. Abadie E., Chiantella C., Crottier A., Rhodes L., Masseret Estelle, Berteaux T., Laabir Mohamed. What are the main environmental factors driving the development of the neurotoxic dinoflagellate Vulcanodinium rugosum in a Mediterranean ecosystem (Ingril lagoon, France) ?. Harmful Algae, 2018, 75, p. 75-86. ISSN 1568-9883

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  2. Abdou K., Lasram F. B., Romdhane M. S., Le Loc'h François, Aubin J. Rearing performances and environmental assessment of sea cage farming in Tunisia using life cycle assessment (LCA) combined with PCA and HCPC. International Journal of Life Cycle Assessment, 2018, 23 (5), p. 1049-1062. ISSN 0948-3349

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  3. Adjeroud Mehdi, Kayal M., Iborra-Cantonnet C., Vercelloni J., Bosserelle P., Liao V., Chancerelle Y., Claudet J., Penin L. Recovery of coral assemblages despite acute and recurrent disturbances on a South Central Pacific reef. Scientific Reports - Nature, 2018, 8, p. art. 9680 [8 p.]. ISSN 2045-2322

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  4. Adjeroud Mehdi, Kayal M., Peignon Christophe, Juncker M., Mills S. C., Beldade R., Dumas Pascal. Ephemeral and localized outbreaks of the coral predator Acanthaster cf. solaris in the southwestern lagoon of New Caledonia. Zoological Studies, 2018, 57, p. 4. ISSN 1021-5506

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  5. Adjeroud Mehdi, Peignon Christophe. La relève assurée ? : un fort recrutement des coraux dans le lagon sud-ouest de Nouvelle-Calédonie [encadré 8]. In : Payri Claude (ed.), Moatti Jean-Paul (pref.). Nouvelle-Calédonie : archipel de corail. Marseille (FRA) ; Nouméa : IRD ; Solaris, 2018, p. 58-59. ISBN 978-2-7099-2632-4

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  6. Agnèse Jean-François, Louizi H., Gilles A., Rkhami O. B., Benhoussa A., Qninba A., Pariselle Antoine. A euryhaline fish, lost in the desert : the unexpected metapopulation structure of Coptodon guineensis (Gunther, 1862) in the Sebkha of Imlili. Comptes Rendus Biologies, 2018, 341 (2), p. 75-84. ISSN 1631-0691

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  7. Aguiar-Santos J., deHart P. A. P., Pouilly Marc, Freitas C. E. C., Siqueira-Souza F. K. Trophic ecology of speckled peacock bass Cichla temensis Humboldt 1821 in the middle Negro River, Amazon, Brazil. Ecology of Freshwater Fish, 2018, 27 (4), p. 1076-1086. ISSN 0906-6691

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  8. Aigle A., Bonin P., Fernandez-Nunez N., Loriod B., Guasco S., Bergon A., Armougom Fabrice, Iobbi-Nivol C., Imbert J., Michotey V. The nature of the electron acceptor (MnIV/NO3) triggers the differential expression of genes associated with stress and ammonium limitation responses in Shewanella algae C6G3. FEMS Microbiology Letters, 2018, 365 (13), p. fny068 [9 p.]. ISSN 0378-1097

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  9. Aime Joanne, Alenbach M., Bourgeois C., Leopold A., Jacotot A., Vinh T. V., Nho N. T., Della Patrona L., Marchand Cyril. Variability of CO2 emissions during the rearing cycle of a semi-intensive shrimp farm in a mangrove coastal zone (New Caledonia). Marine Pollution Bulletin, 2018, 129 (1), p. 194-206. ISSN 0025-326X

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  10. Ait-Mouheb N., Bahri A., Ben Thayer B., Benyahia B., Bourrie G., Cherki B., Condom N., Declercq R., Gunes A., Heran M., Kitir N., Molle B., Patureau D., Pollice A., Rapaport A., Renault P., Riahi K., Romagny Bruno, Sari T., Sinfort C., Steyer J. P., Talozi S., Topcuoglu B., Turan M., Wery N., Yildirim E., Harmand J. The reuse of reclaimed water for irrigation around the Mediterranean Rim : a step towards a more virtuous cycle ?. Regional Environmental Change, 2018, 18 (3), p. 693-705. ISSN 1436-3798

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  11. Albert A., Andre M., Anghinolfi M., Anton G., Ardid M., Aubert J. J., Aublin J., Avgitas T., Baret B., Barrios-Marti J., Basa S., Belhorma B., Bertin V., Biagi S., Bormuth R., Bourret S., Bouwhuis M. C., Branzas H., Bruijn R., Brunner J., Busto J., Capone A., Caramete L., Carr J., Celli S., El Moursli R. C., Chiarusi T., Circella M., Coelho J. A. B., Coleiro A., Coniglione R., Costantini H., Coyle P., Creusot A., Diaz A. F., Deschamps A., De Bonis G., Distefano C., Di Palma I., Domi A., Donzaud C., Dornic D., Drouhin D., Eberl T., El Bojaddaini I., El Khayati N., Elsasser D., Enzenhofer A., Ettahiri A., Fassi F., Felis I., Fusco L. A., Gay P., Giordano V., Glotin H., Gregoire T., Ruiz R. G., Graf K., Hallmann S., van Haren H., Heijboer A. J., Hello Yann, Hernandez-Rey J. J., Hossl J., Hofestadt J., Illuminati G., James C. W., de Jong M., Jongen M., Kadler M., Kalekin O., Katz U., Kiessling D., Kouchner A., Kreter M., Kreykenbohm I., Kulikovskiy V., Lachaud C., Lahmann R., Lefevre D., Leonora E., Lotze M., Loucatos S., Marcelin M., Margiotta A., Marinelli A., Martinez-Mora J. A., Mele R., Melis K., Michael T., Migliozzi P., Moussa A., Navas S., Nezri E., Organokov M., Pavalas G. E., Pellegrino C., Perrina C., Piattelli P., Popa V., Pradier T., Quinn L., Racca C., Riccobene G., Sanchez-Losa A., Saldana M., Salvadori I., Samtleben D. F. E., Sanguineti M., Sapienza P., Schussler F., Sieger C., Spurio M., Stolarczyk T., Taiuti M., Tayalati Y., Trovato A., Turpin D., Tonnis C., Vallage B., Van Elewyck V., Versari F., Vivolo D., Vizzoca A., Wilms J., Zornoza J. D., Zuniga J., ANTARES Collaboration. All-flavor search for a diffuse flux of cosmic neutrinos with nine years of ANTARES data. Astrophysical Journal Letters, 2018, 853 (1), p. L7. ISSN 2041-8205

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  12. Albertson G. R., Friedlaender A. S., Steel D. J., Aguayo-Lobo A., Bonatto S. L., Caballero S., Constantine R., Cypriano-Souza A. L., Engel M. H., Garrigue Claire, Florez-Gonzalez L., Johnston D. W., Nowacek D. P., Olavarria C., Poole M. M., Read A. J., Robbins J., Sremba A. L., Baker C. S. Temporal stability and mixed-stock analyses of humpback whales (Megaptera novaeangliae) in the nearshore waters of the Western Antarctic Peninsula. Polar Biology, 2018, 41 (2), p. 323-340. ISSN 0722-4060

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  13. Almar Rafaël, Lerma A. N., Castelle B., Scott T. On the influence of reflection over a rhythmic swash zone on surf zone dynamics. Ocean Dynamics, 2018, 68 (7), p. 899-909. ISSN 1616-7341

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  14. Alves F. D., De Lemos R. D. F., Cardoso I. A., De Araujo Mdlc, Bertrand Arnaud, Souza J. F. New records of deep-sea prawn of the genus Gennadas Spence Bate, 1881 (Crustacea : Decapoda : Benthesicymidae) from Southwestern Atlantic. Zootaxa, 2018, 4450 (3), p. 376-384. ISSN 1175-5326

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  15. Alves-Junior F. A., Bertrand Arnaud, Melo Pamc, Correia E. P., Figueiredo L. G. P., Neumann-Leitao S. First record of a rare deep-sea copepod, Gaussia intermedia defaye, 1998 (Calanoida, Metridinidae), from the Atlantic ocean. Crustaceana, 2018, 91 (4), p. 501-508. ISSN 0011-216X

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  16. Ampou E. E., Ouillon Sylvain, Andréfouët Serge. Challenges in rendering Coral Triangle habitat richness in remotely sensed habitat maps : the case of Bunaken Island (Indonesia). In : Indonesia seas management. Marine Pollution Bulletin, 2018, 131 Part B (No spécial), p. 72-82. ISSN 0025-326X

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  17. Ampou E. E., Ouillon Sylvain, Iovan Corina, Andréfouët Serge. Change detection of Bunaken Island coral reefs using 15 years of very high resolution satellite images : a kaleidoscope of habitat trajectories. In : Indonesia seas management. Marine Pollution Bulletin, 2018, 131 Part B (No spécial), p. 83-95. ISSN 0025-326X

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  18. Andrade M. C., Jégu Michel, Buckup P. A., Netto-Ferreira A. L. A new Myleus species (Characiformes : Serrasalmidae) from the Rio Tapajos basin, Brazil. Journal of Fish Biology, 2018, 92 (6), p. 1902-1914. ISSN 0022-1112

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  19. Andrade M. C., Jégu Michel, Gama C. S. A new species of Myloplus Gill (Characiformes, Serrasalmidae) from the Tumucumaque Mountain Range, Brazil and French Guiana, with comments on M. rubripinnis. Zootaxa, 2018, 4403 (1), p. 111-122. ISSN 1175-5326

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  20. Andrello M., Kaplan David, Lett Christophe, Manel S., Mouillot D. Connectivité des populations marines : modélisation individu-centrée des échanges de larves de mérou au sein du réseau d'aires marines protégées de la Méditerranée. In : Arnaud N. (ed.), Jouve B. (ed.), Müller J.P. (ed.) Systèmes complexes : de la biologie aux territoires. Montpellier : Agropolis International, 2018, (23), p. 36. (Dossiers d'Agropolis International ; 23). ISSN 1628-4240

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  21. Andreote A. P. D., Dini-Andreote F., Rigonato J., Machineski G. S., Souza B. C. E., Barbiéro Laurent, Rezende A. T., Fiore M. F. Contrasting the genetic patterns of microbial communities in Soda lakes with and without cyanobacterial bloom. Frontiers in Microbiology, 2018, 9, p. art. 244 [13 p.]. ISSN 1664-302X

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  22. Andriolo U., Almeida L. P., Almar Rafaël. Coupling terrestrial LiDAR and video imagery to perform 3D intertidal beach topography. Coastal Engineering, 2018, 140, p. 232-239. ISSN 0378-3839

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  23. Andréfouët Serge, Van Wynsberge S., Kabbadj L., Wabnitz C. C. C., Menkès Christophe, Tamata T., Pahuatini M., Tetairekie I., Teaka I., Scha T. A., Teaka T., Remoissenet G. Adaptive management for the sustainable exploitation of lagoon resources in remote islands : lessons from a massive El Nino-induced giant clam bleaching event in the Tuamotu atolls (French Polynesia). Environmental Conservation, 2018, 45 (1), p. 30-40. ISSN 0376-8929

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  24. Andréfouët Serge. Les habitats des récifs et lagons néo-calédoniens. In : Payri Claude (ed.), Moatti Jean-Paul (pref.). Nouvelle-Calédonie : archipel de corail. Marseille (FRA) ; Nouméa : IRD ; Solaris, 2018, p. 29-32. ISBN 978-2-7099-2632-4

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  25. Angnuureng D. B., Addo K. A., Almar Rafaël, Dieng H. Influence of sea level variability on a micro-tidal beach. Natural Hazards, 2018, 93 (3), p. 1611-1628. ISSN 0921-030X

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  26. Annasawmy P., Ternon Jean-François, Marsac Francis, Cherel Y., Behagle Nolwenn, Roudaut Gildas, Lebourges Dhaussy Anne, Demarcq Hervé, Moloney C. L., Jaquemet S., Ménard Frédéric. Micronekton diel migration, community composition and trophic position within two biogeochemical provinces of the South West Indian Ocean : insight from acoustics and stable isotopes. Deep-Sea Research Part I : Oceanographic Research Papers, 2018, 138, p. 85-97. ISSN 0967-0637

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  27. Archundia D., Boithias Laurie, Duwig Céline, Morel M. C., Aviles G. F., Martins J. M. F. Environmental fate and ecotoxicological risk of the antibiotic sulfamethoxazole across the Katari catchment (Bolivian Altiplano) : application of the GREAT-ER model. Science of the Total Environment, 2018, 622, p. 1046-1055. ISSN 0048-9697

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  28. Ardhuin F., Aksenov Y., Benetazzo A., Bertino L., Brandt P., Caubet E., Chapron B., Collard F., Cravatte Sophie, Delouis J. M., Dias F., Dibarboure G., Gaultier L., Johannessen J., Korosov A., Manucharyan G., Menemenlis D., Menendez M., Monnier G., Mouche A., Nouguier F., Nurser G., Rampal P., Reniers A., Rodriguez E., Stopa J., Tison C., Ubelmann C., van Sebille E., Xie J. P. Measuring currents, ice drift, and waves from space : the Sea surface KInematics Multiscale monitoring (SKIM) concept. Ocean Science, 2018, 14 (3), p. 337-354. ISSN 1812-0784

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  29. Aucan Jérôme (coord.). Des récifs impactés mais résistants : partie 3. In : Payri Claude (ed.), Moatti Jean-Paul (pref.). Nouvelle-Calédonie : archipel de corail. Marseille (FRA) ; Nouméa : IRD ; Solaris, 2018, p. 145-177. ISBN 978-2-7099-2632-4

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010073389

  30. Autret R., Dodet G., Suanez S., Roudaut Gildas, Fichaut B. Long-term variability of supratidal coastal boulder activation in Brittany (France). Geomorphology, 2018, 304, p. 184-200. ISSN 0169-555X

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  31. Avadi A., Adrien R., Aramayo V., Fréon Pierre. Environmental assessment of the Peruvian industrial hake fishery with LCA. International Journal of Life Cycle Assessment, 2018, 23 (5), p. 1126-1140. ISSN 0948-3349

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  32. Ba K., Thiaw M., Fall M., Thiam N., Meissa B., Jouffre Didier, Thiaw O. T., Gascuel D. Long-term fishing impact on the Senegalese coastal demersal resources : diagnosing from stock assessment models. Aquatic Living Resources, 2018, 31, p. art. 8 [13 p.]. ISSN 0990-7440

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  33. Bader Jean-Claude, Lemoalle Jacques. Mise à jour du modèle hydrologique du lac Tchad : données, paramètres et implémentation. Montpellier : IRD, 2018, 40 p. multigr.

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  34. Barbiéro Laurent, Neto M. S., Braz R. R., do Carmo J. B., Rezende A. T., Mazzi E., Fernandes F. A., Damatto S. R., de Camargo P. B. Biogeochemical diversity, O-2-supersaturation and hot moments of GHG emissions from shallow alkaline lakes in the Pantanal of Nhecolandia, Brazil. Science of the Total Environment, 2018, 619, p. 1420-1430. ISSN 0048-9697

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  35. Barbot S., Petrenko A., Maes Christophe. Intermediate water flows in the western South Pacific : as revealed by individual Argo floats trajectories and a model re-analysis. Biogeosciences, 2018, 15 (13), p. 4103-4124. ISSN 1726-4170

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  36. Barbot S., Petrenko A., Maes Christophe. Intermediate water flows in the western South Pacific : as revealed by individual Argo floats trajectories and a model re-analysis. Biogeosciences, 2018, 15, p. 4103-4124. ISSN 1726-4170

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  37. Barbraud C., Bertrand Arnaud, Bouchon M., Chaigneau Alexis, Delord K., Demarcq Hervé, Gimenez O., Torero M. G., Gutierrez D., Oliveros-Ramos R., Passuni G., Tremblay Yann, Bertrand Sophie. Density dependence, prey accessibility and prey depletion by fisheries drive Peruvian seabird population dynamics. Ecography, 2018, 41 (7), p. 1092-1102. ISSN 0906-7590

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  38. Barhoumi B., Castro-Jimenez J., Guigue C., Goutx M., Sempere R., Derouiche A., Achour A., Touil S., Driss M. R., Tedetti Marc. Levels and risk assessment of hydrocarbons and organochlorines in aerosols from a North African coastal city (Bizerte, Tunisia). Environmental Pollution, 2018, 240, p. 422-431. ISSN 0269-7491

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  39. Barraza F., Maurice Laurence, Uzu Gaëlle, Becerra S., López F., Ochoa-Herrera V., Ruales J., Schreck E. Distribution, contents and health risk assessment of metal(loid)s in small-scale farms in the Ecuadorian Amazon : an insight into impacts of oil activities. Science of the Total Environment, 2018, 622-623, p. 106-120. ISSN 0048-9697

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  40. Ben Abdallah M., Karray F., Kallel N., Armougom Fabrice, Mhiri N., Quéméneur Marianne, Cayol J. L., Erauso G., Sayadi S. Abundance and diversity of prokaryotes in ephemeral hypersaline lake Chott El Jerid using Illumina Miseq sequencing, DGGE and qPCR assays. Extremophiles, 2018, 22 (5), p. 811-823. ISSN 1431-0651

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  41. Ben Othman H., Lanouguere E., Got P., Hlaili A. S., Leboulanger Christophe. Structural and functional responses of coastal marine phytoplankton communities to PAH mixtures. Chemosphere, 2018, 209, p. 908-919. ISSN 0045-6535

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010074003 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  42. Ben Ouada S., Ben Ali R., Leboulanger Christophe, Ben Ouada H., Sayadi S. Effect of Bisphenol A on the extremophilic microalgal strain Picocystis sp. (Chlorophyta) and its high BPA removal ability. Ecotoxicology and Environmental Safety, 2018, 158, p. 1-8. ISSN 0147-6513

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  43. Ben Ouada S., Ben Ali R., Leboulanger Christophe, Zaghden H., Choura S., Ben Ouada H., Sayadi S. Effect and removal of bisphenol A by two extremophilic microalgal strains (Chlorophyta). Journal of Applied Phycology, 2018, 30 (3), p. 1765-1776. ISSN 0921-8971

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010073142 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  44. Benavides M., Shoemaker K. M., Moisander P. H., Niggemann J., Dittmar T., Duhamel S., Grosso O., Pujo-Pay M., Helias-Nunige S., Fumenia A., Bonnet Sophie. Aphotic N-2 fixation along an oligotrophic to ultraoligotrophic transect in the western tropical South Pacific Ocean. Biogeosciences, 2018, 15 (9), p. 3107-3119. ISSN 1726-4170

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  45. Benedetti F., Guilhaumon François, Adloff F., Ayata S. D. Investigating uncertainties in zooplankton composition shifts under climate change scenarios in the Mediterranean Sea. Ecography, 2018, 41 (2), p. 345-360. ISSN 0906-7590

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  46. Benedetti F., Vogt M., Righetti D., Guilhaumon François, Ayata S. D. Do functional groups of planktonic copepods differ in their ecological niches ?. Journal of Biogeography, 2018, 45 (3), p. 604-616. ISSN 0305-0270

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  47. Benzoni Francesca, Arrigoni R., Berumen M. L., Taviani M., Bongaerts P., Frade P. R. Morphological and genetic divergence between Mediterranean and Caribbean populations of Madracis pharensis (Heller 1868) (Scleractinia, Pocilloporidae) : too much for one species ?. Zootaxa, 2018, 4471 (3), p. 473-492. ISSN 1175-5326

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  48. Benzoni Francesca. Les coraux des récifs de Nouvelle-Calédonie, un patrimoine diversifié et précieux. In : Payri Claude (ed.), Moatti Jean-Paul (pref.). Nouvelle-Calédonie : archipel de corail. Marseille (FRA) ; Nouméa : IRD ; Solaris, 2018, p. 49-59. ISBN 978-2-7099-2632-4

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010073403

  49. Bergsma E. W. J., Almar Rafaël. Video-based depth inversion techniques, a method comparison with synthetic cases. Coastal Engineering, 2018, 138, p. 199-209. ISSN 0378-3839

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  50. Bettarel Yvan, Combe Marine, Adingra A., Ndiaye A., Bouvier T., Panfili Jacques, Durand Jean-Dominique. Hordes of phages in the gut of the Tilapia Sarotherodon melanotheron. Scientific Reports - Nature, 2018, 8, p. art. 11311 [6 p.]. ISSN 2045-2322

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