Horizon / Plein textes La base de ressources documentaires de l'IRD

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Publications des scientifiques de l'IRD

2017 - Sciences du monde végétal et animal - Articles

  1. Abat Cédric, Rolain J. M., Dubourg G., Fournier P. E., Chaudet H., Raoult D. Evaluating the clinical burden and mortality attributable to antibiotic resistance : the disparity of empirical data and simple model estimations. Clinical Infectious Diseases, 2017, 65 (Suppl. 1), p. S58-S63. ISSN 1058-4838

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  2. Abdel-Rahman E. M., Landmann T., Kyalo R., Ong'amo G., Mwalusepo S., Sulieman S., Le Rü Bruno. Predicting stem borer density in maize using RapidEye data and generalized linear models. International Journal of Applied Earth Observation and Geoinformation, 2017, 57, p. 61-74. ISSN 0303-2434

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  3. Acuna-Villaorduna C., Orikiriza R., Nyehangane D., White L. F., Mwanga-Arnumpaire J., Kim S., Bonnet Maryline, Fennelly K. P., Boum Y., Jones-Lopez E. C. Effect of previous treatment and sputum quality on diagnostic accuracy of Xpert((R)) MTB/RIF. International Journal of Tuberculosis and Lung Disease, 2017, 21 (4), p. 389-397. ISSN 1027-3719

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  4. Agier L., Martiny N., Thiongane Oumy, Mueller J. E., Paireau J., Watkins E. R., Irving T. J., Koutangni T., Broutin H. Towards understanding the epidemiology of Neisseria meningitidis in the African meningitis belt : a multi-disciplinary overview. International Journal of Infectious Diseases, 2017, 54, p. 103-112. ISSN 1201-9712

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  5. Ahuka-Mundeke S., Ayouba Ahidjo, Mbala-Kingebeni P., Foncelle C., Mubonga M., Ndimbo-Kumugo S. P., Lunguya-Metila O., Mbenzo-Abokome V., Muyembe-Tamfum J. J., Delaporte Eric, Peeters Martine. High prevalences and a wide genetic diversity of simian retroviruses in non-human primate bushmeat in rural areas of the Democratic Republic of Congo [+ Erratum]. Ecohealth, 2017, 14 (1), p. 100-114 + erratum. ISSN 1612-9202

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  6. Ahuka-Mundeke S., Mbala-Kingebeni P., Ndimbo-Kumogo S. P., Foncelle C., Lunguya-Metila O., Muyembe-Tamfum J. J., Delaporte Eric, Peeters Martine, Ayouba Ahidjo. Full genome characterization of a new simian immune deficiency virus lineage in a naturally infected cercopithecus ascanius whitesidei in the Democratic Republic of Congo reveals high genetic diversity among red-tailed monkeys in Central and Eastern Africa. AIDS Research and Human Retroviruses, 2017, 33 (7), p. 735-739. ISSN 0889-2229

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  7. Akakpo R., Scarcelli Nora, Chair H., Dansi A., Djedatin G., Thuillet Anne-Céline, Rhoné Bénédicte, Francois O., Alix K., Vigouroux Yves. Molecular basis of African yam domestication : analyses of selection point to root development, starch biosynthesis, and photosynthesis related genes. BMC Genomics, 2017, 18, p. art. 782 [9 p.]. ISSN 1471-2164

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  8. Ali N., Tavoillot Johannes, Besnard G., Khadari B., Dmowska E., Winiszewska G., Fossati-Gaschignard O., Ater M., Hamza M. A., El Mousadik A., El Oualkadi A., Moukhli A., Essalouh L., El Bakkali A., Chapuis Elodie, Mateille Thierry. How anthropogenic changes may affect soil-borne parasite diversity ? Plant-parasitic nematode communities associated with olive trees in Morocco as a case study. BMC Ecology, 2017, 17, p. art. 4 [31 p.]. ISSN 1472-6785

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  9. Almar Rafael, Marchesiello Patrick, Almeida L.P., Duong Hai Thuan, Tanaka H., Nguyen Trung Viet. Shoreline response to a sequence of typhoon and monsoon events. In : Ouillon Sylvain (ed.). Sediment transport in coastal waters. Water, 2017, 9 (6 (no spécial)), art. 364 [8 p.] ISSN 2073-4441

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  10. Alou M. T., Million M., Traore S. I., Mouelhi D., Khelaifia S., Bachar D., Caputo A., Delerce J., Brah S., Alhousseini D., Sokhna Cheikh, Robert C., Diallo B. A., Diallo A., Parola P., Golden M., Lagier J. C., Raoult D. Gut bacteria missing in severe acute malnutrition, can we identify potential probiotics by culturomics ?. Frontiers in Microbiology, 2017, 8, p. art. 899 [17 p.]. ISSN 1664-302X

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  11. Alou M. T., Rathored J., Michelle C., Dubourg G., Andrieu C., Armstrong N., Sokhna Cheikh, Diallo A., Raoult D., Fournier P. E. Inediibacterium massiliense gen. nov., sp. nov., a new bacterial species isolated from the gut microbiota of a severely malnourished infant. Antonie Van Leeuwenhoek International = Journal of General and Molecular Microbiology, 2017, 110 (6), p. 737-750. ISSN 0003-6072

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  12. Alves G. S. C., Torres L. F., Dechamp E., Breitler J. C., Joët Thierry, Gatineau F., Andrade A. C., Bertrand B., Marraccini P., Etienne H. Differential fine-tuning of gene expression regulation in coffee leaves by CcDREB1D promoter haplotypes under water deficit. Journal of Experimental Botany, 2017, 68 (11), p. 3017-3031. ISSN 0022-0957

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  13. Amanzougaghene N., Fenollar F., Sangare A. K., Sissoko M. S., Doumbo O. K., Raoult D., Mediannikov Oleg. Detection of bacterial pathogens including potential new species in human head lice from Mali. PLOS One, 2017, 12 (9), p. e0184621 [18 p.]. ISSN 1932-6203

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  14. Amsellem L., Brouat Carine, Duron O., Porter S. S., Vilcinskas A., Facon B. Importance of microorganisms to macroorganisms invasions : is the essential invisible to the eye ? (The Little Prince, A. de Saint-Exupery, 1943). In : Bohan D. A. (ed.), Dumbrell A. J. (ed.), Massol F. (ed.) Networks of invasion : empirical evidence and case studies . Advances in Ecological Research, 2017, 57, p. 99-146.

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  15. Amziane M., Darenfed-Bouanane A., Abderrahmani A., Selama O., Jouadi L., Cayol J. L., Nateche F., Fardeau Marie-Laure. Virgibacillus ainsalahensis sp. nov., a moderately halophilic bacterium isolated from sediment of a saline lake in south of Algeria. Current Microbiology, 2017, 74 (2), p. 219-223. ISSN 0343-8651

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  16. Anthelme Fabien, Meneses R. I., Valero N. N. H., Pozo P., Dangles Olivier. Fine nurse variations explain discrepancies in the stress-interaction relationship in alpine regions. Oikos, 2017, 126 (8), p. 1173-1183. ISSN 0030-1299

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  17. Archundia D., Duwig Céline, Spadini L., Uzu Gaëlle, Guédron Stéphane, Morel M. C., Cortez R., Ramos O. R., Chincheros J., Martins J. M. F. How uncontrolled urban expansion increases the contamination of the Titicaca Lake Basin (El Alto, La Paz, Bolivia). Water Air and Soil Pollution, 2017, 228 (1), p. art. 44 [ p.]. ISSN 0049-6979

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  18. Assefa Y., Goftishu M., Capdevielle Dulac Claire, Le Rü Bruno. Clarifying the source of Conicofrontia sesamoides Hampson (Lepidoptera : Noctuidae) population in South African sugarcane using morphological identification and mitochondrial DNA analysis. Phytoparasitica, 2017, 45 (1), p. 45-55. ISSN 0334-2123

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  19. Assouma M. H., Serca D., Guérin Frédéric, Blanfort V., Lecomte P., Toure I., Ickowicz A., Manlay R. J., Bernoux Martial, Vayssieres J. Livestock induces strong spatial heterogeneity of soil CO2, N2O and CH4 emissions within a semi-arid sylvo-pastoral landscape in West Africa. Journal of Arid Land, 2017, 9 (2), p. 210-221. ISSN 1674-6767

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  20. Awessou K. G. B., Peugeot Christophe, Rocheteau Alain, Séguis Luc, Do Frédéric, Galle Sylvie, Bellanger M., Agbossou E., Seghieri Josiane. Differences in transpiration between a forest and an agroforestry tree species in the Sudanian belt. Agroforestry Systems, 2017, 91 (3), p. 403-413. ISSN 0167-4366

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  21. Ayhan N., Baklouti A., Prudhomme Jorian, Walder G., Amaro F., Alten B., Moutailler S., Ergunay K., Charrel R. N., Huemer H. Practical guidelines for studies on sandfly-borne phleboviruses : Part I. Important points to consider ante field work. Vector-Borne and Zoonotic Diseases, 2017, 17 (1), p. 73-80. ISSN 1530-3667

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  22. Ayyoub A., Er-Raki S., Khabba S., Merlin Olivier, Ezzahar J., Rodriguez J. C., Bahlaoui A., Chehbouni Abdelghani. A simple and alternative approach based on reference evapotranspiration and leaf area index for estimating tree transpiration in semi-arid regions. Agricultural Water Management, 2017, 188, p. 61-68. ISSN 0378-3774

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  23. Bacaër Nicolas. Sur la vitesse d’extinction d’une population dans un environnement aléatoire. Comptes Rendus Biologies, 2017, 340 (5), p. 259-263. ISSN 1631-0691

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  24. Badshah H., Ullah F., Calatayud Paul-André, Ullah H., Ahmad B. Can toxicants used against cotton mealybug Phenacoccus solenopsis be compatible with an encyrtid parasitoid Aenasius bambawalei under laboratory conditions ?. Environmental Science and Pollution Research, 2017, 24 (6), p. 5857-5867. ISSN 0944-1344

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  25. Bahir M., Boulet Gilles, Olioso A., Rivalland V., Gallego-Elvira B., Mira M., Rodriguez J. C., Jarlan Lionel, Merlin Olivier. Evaluation and aggregation properties of thermal infra-red-based evapotranspiration algorithms from 100 m to the km scale over a semi-arid irrigated agricultural area. Remote Sensing, 2017, 9 (11), p. art. 1178 [27 p.]. ISSN 2072-4292

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  26. Barbosa A. N., Boyer L., Chippaux Jean-Philippe, Medolago N. B., Caramori C. A., Paixao A. G., Poli J. P. V., Mendes M. B., dos Santos L. D., Ferreira R. S., Barraviera B. A clinical trial protocol to treat massive Africanized honeybee (Apis mellifera) attack with a new apilic antivenom. Journal of Venomous Animals and Toxins Including Tropical Diseases, 2017, 23 (1), p. art. 14 [10 p.]. ISSN 1678-9199

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  27. Barnaud Adeline, Vigouroux Yves, Diallo M. T., Saidou S. I., Piquet M., Barry M. B., Bakasso Y., Zekraoui Leila, Rivallan R., Kane N. A., Billot C. High selfing rate inferred for white fonio [Digitaria exilis (Kippist.) Stapf] reproductive system opens up opportunities for breeding programs. Genetic Resources and Crop Evolution, 2017, 64 (7), p. 1485-1490. ISSN 0925-9864

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  28. Barot Sébastien, Allard V., Cantarel A., Enjalbert J., Gauffreteau A., Goldringer I., Lata J. C., Le Roux X., Niboyet A., Porcher E. Designing mixtures of varieties for multifunctional agriculture with the help of ecology : a review. Agronomy for Sustainable Development, 2017, 37 (2), p. art. 13 [20 p.]. ISSN 1774-0746

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  29. Barot Sébastien, Ye L., Abbadie L., Blouin M., Frascaria-Lacoste N. Ecosystem services must tackle anthropized ecosystems andecological engineering. Ecological Engineering, 2017, 99, p. 486-495. ISSN 0925-8574

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  30. Barraza F., Schreck E., Leveque T., Uzu Gaëlle, Lopez F., Ruales J., Prunier J., Marquet A., Maurice Laurence. Cadmium bioaccumulation and gastric bioaccessibility in cacao : a field study in areas impacted by oil activities in Ecuador. Environmental Pollution, 2017, 229, p. 950-963. ISSN 0269-7491

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010070985 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  31. Barrière Q., Guefrachi I., Gully Djamel, Lamouche F., Pierre O., Fardoux Joël, Chaintreuil Clémence, Alunni B., Timchenko T., Giraud Eric, Mergaert P. Integrated roles of BclA and DD-carboxypeptidase 1 in Bradyrhizobium differentiation within NCR-producing and NCR-lacking root nodules. Scientific Reports - Nature, 2017, 7, p. art. 9063 [13 p.]. ISSN 2045-2322

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  32. Barthe S., Binelli G., Herault B., Scotti-Saintagne C., Sabatier Daniel, Scotti I. Tropical rainforests that persisted : inferences from the Quaternary demographic history of eight tree species in the Guiana shield. Molecular Ecology, 2017, 26 (4), p. 1161-1174. ISSN 0962-1083

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  33. Battude M., Al Bitar A., Brut A., Tallec T., Huc M., Cros J., Weber J. J., Lhuissier L., Simonneaux Vincent, Demarez V. Modeling water needs and total irrigation depths of maize crop in the south west of France using high spatial and temporal resolution satellite imagery. Agricultural Water Management, 2017, 189, p. 123-136. ISSN 0378-3774

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  34. Ben Hania W., Joseph Manon, Bunk B., Sproer C., Klenk H. P., Fardeau Marie-Laure, Spring S. Characterization of the first cultured representative of a Bacteroidetes clade specialized on the scavenging of cyanobacteria. Environmental Microbiology, 2017, 19 (3), p. 1134-1148. ISSN 1462-2912

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  35. Benacer D., Thong K. L., Ooi P. T., Souris Marc, Lewis J. W., Ahmed A. A., Zain S. N. M. Serological and molecular identification of Leptospira spp. in swine and stray dogs from Malaysia. Tropical Biomedicine, 2017, 34 (1), p. 89-97. ISSN 0127-5720

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  36. Benkhoua N., Hafidi M., Badri W., Baudoin Ezékiel, Thioulouse J., Prin Y., Galiana A., Ouahmane L., Ouhammou A., Sanguin H., Duponnois Robin. Management of the mycorrhizal soil infectivity with Crotalaria ochroleuca, an indigenous wild legume in the tropics: Impacts on microbial functional diversity involved in phosphorus mobilizationprocesses in a sahelian soil. Ecological Engineering, 2017, 101, p. 130-136. ISSN 0925-8574

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  37. Benoist R., Chantre C., Capdevielle Dulac Claire, Bodet M., Mougel F., Calatayud Paul-André, Dupas Stéphane, Huguet E., Jeannette Rémi, Obonyo J., Odorico C., Silvain Jean-François, Le Rü Bruno, Kaiser L. Relationship between oviposition, virulence gene expression and parasitism success in Cotesia typhae nov. sp. parasitoid strains. Genetica, 2017, 145 (6), p. 469-479. ISSN 0016-6707

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  38. Biarnès Anne, Andrieux P., Barbier J.M., Bonnefoy A., Compangone C., Delpuech X., Gary C., Metay A., Rellier J.P., Voltz M. Evaluer par modélisation des stratégies de réduction des usages d’herbicides dans les bassins versants viticoles. In : Captages d’eau potable : accompagner les transitions dans les territoires agricoles. Innovations Agronomiques, 2017, 57, p. 141-152. Colloque CIAg : Captages d’Eau Potable : Accompagner les Transitions dans les Territoires Agricoles , Montpellier (FRA), 2017/05/11. ISSN 1958-5853

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  39. Biscornet L., Dellagi Koussay, Pages F., Bibi J., de Comarmond J., Melade J., Govinden G., Tirant M., Gomard Y., Guernier V., Lagadec E., Melanie J., Rocamora G., le Minter G., Jaubert J., Mavingui P., Tortosa P. Human leptospirosis in Seychelles : a prospective study confirms the heavy burden of the disease but suggests that rats are not the main reservoir. PLOS Neglected Tropical Diseases, 2017, 11 (8), p. e0005831 [22 p.]. ISSN 1935-2735

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  40. Bitome-Essono P. Y., Ollomo B., Arnathau C., Durand P., Mokoudoum N. D., Yacka-Mouele L., Okouga A. P., Boundenga L., Mve-Ondo B., Obame-Nkoghe J., Mbehang-Nguema P., Njiokou F., Makanga B., Wattier R., Ayala Diego, Ayala F. J., Prugnolle F., Paupy Christophe. Tracking zoonotic pathogens using bloodsucking flies as 'flying syringes'. eLIFE, 2017, 6, p. e22069 [22 p.]. ISSN 2050-084X

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010070023 Lien chez l'éditeur Fichier au format PDF

  41. Blanco J., Michon Geneviève, Carrière Stéphanie M. Natural ecosystem mimicry in traditional dryland agroecosystems : insights from empirical and holistic approach. Journal of Environmental Management, 2017, 204, p. 111-122. ISSN 0301-4797

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010070801 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  42. Blanvillain-Baufumé Servane, Reschke M., Sole M., Auguy Florence, Doucoure H., Szurek Boris, Meynard D., Portefaix M., Cunnac Sébastien, Guiderdoni E., Boch J., Koebnik Ralf. Targeted promoter editing for rice resistance to Xanthomonas oryzae pv. oryzae reveals differential activities for SWEET14-inducing TAL effectors. Plant Biotechnology Journal, 2017, 15 (3), p. 306-317. ISSN 1467-7644

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  43. Bonnet Maryline, San K. C., Pho Y., Sok C., Dousset J. P., Brant W., Hurtado N., Eam K. K., Ardizzoni E., Heng S. H., Godreuil S., Yew W. W., Hewison C. Nontuberculous mycobacteria infections at a provincial reference hospital, Cambodia. Emerging Infectious Diseases, 2017, 23 (7), p. 1139-1147. ISSN 1080-6040

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010070206 Lien chez l'éditeur Fichier au format PDF

  44. Boone A., Samuelsson P., Gollvik S., Napoly A., Jarlan Lionel, Brun E., Decharme B. The interactions between soil-biosphere-atmosphere land surface model with a multi-energy balance (ISBA-MEB) option in SURFEXv8-Part 1 : Model description. Geoscientific Model Development, 2017, 10 (2), p. 843-872. ISSN 1991-959X

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010069292 Lien chez l'éditeur Fichier au format PDF

  45. Boratynski Z., Brito J. C., Campos J. C., Cunha J. L., Granjon Laurent, Mappes T., Ndiaye A., Rzebik-Kowalska B., Seren N. Repeated evolution of camouflage in speciose desert rodents. Scientific Reports - Nature, 2017, 7, p. art. 3522 [10 p.]. ISSN 2045-2322

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  46. Bottinelli Nicolas, Angers D. A., Hallaire V., Michot D., Le Guillou C., Cluzeau D., Heddadj D., Menasseri-Aubry S. Tillage and fertilization practices affect soil aggregate stability in a humic Cambisol of Northwest France. Soil and Tillage Research, 2017, 170, p. 14-17. ISSN 0167-1987

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  47. Bottinelli Nicolas, Zhou H., Capowiez Y., Zhang Z. B., Qiu J., Jouquet Pascal, Peng X. H. Earthworm burrowing activity of two non-Lumbricidae earthworm species incubated in soils with contrasting organic carbon content (Vertisol vs. Ultisol). Biology and Fertility of Soils, 2017, 53 (8), p. 951-955. ISSN 0178-2762

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  48. Boughattas I., Hattab S., Boussetta H., Banni M., Navarro Elisabeth. Impact of heavy metal contamination on oxidative stress of Eisenia andrei and bacterial community structure in Tunisian mine soil. Environmental Science and Pollution Research, 2017, 24 (22), p. 18083-18095. ISSN 0944-1344

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  49. Boundenga L., Perkins S. L., Ollomo B., Rougeron V., Leroy Eric, Renaud F., Prugnolle Franck. Haemosporidian parasites of reptiles and birds from Gabon, Central Africa. Journal of Parasitology, 2017, 103 (4), p. 330-337. ISSN 0022-3395

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  50. Bourdier Frédéric. Governing Cambodia's forests. The international politics of policy reform. Andrew Cock (Copenhagen : NIAS Press, 2016) [Book Review]. Journal of Contemporary Asia, 2017, 47 (4), p. 671-674. ISSN 0047-2336

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010070862 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  51. Bourdy Geneviève, Aubertin Catherine, Jullian Valérie, Deharo Eric. Quassia "biopiracy" case and the Nagoya Protocol : a researcher's perpective. Journal of Ethnopharmacology, 2017, 4 (4), p. 290-297. ISSN 0378-8741

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