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Publications des scientifiques de l'IRD

2017 - Sciences du monde végétal et animal

  1. Abat Cédric, Rolain J. M., Dubourg G., Fournier P. E., Chaudet H., Raoult D. Evaluating the clinical burden and mortality attributable to antibiotic resistance : the disparity of empirical data and simple model estimations. Clinical Infectious Diseases, 2017, 65 (Suppl. 1), p. S58-S63. ISSN 1058-4838

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  2. Abdel-Rahman E. M., Landmann T., Kyalo R., Ong'amo G., Mwalusepo S., Sulieman S., Le Rü Bruno. Predicting stem borer density in maize using RapidEye data and generalized linear models. International Journal of Applied Earth Observation and Geoinformation, 2017, 57, p. 61-74. ISSN 0303-2434

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  3. Acuna-Villaorduna C., Orikiriza R., Nyehangane D., White L. F., Mwanga-Arnumpaire J., Kim S., Bonnet Maryline, Fennelly K. P., Boum Y., Jones-Lopez E. C. Effect of previous treatment and sputum quality on diagnostic accuracy of Xpert((R)) MTB/RIF. International Journal of Tuberculosis and Lung Disease, 2017, 21 (4), p. 389-397. ISSN 1027-3719

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  4. Agier L., Martiny N., Thiongane Oumy, Mueller J. E., Paireau J., Watkins E. R., Irving T. J., Koutangni T., Broutin H. Towards understanding the epidemiology of Neisseria meningitidis in the African meningitis belt : a multi-disciplinary overview. International Journal of Infectious Diseases, 2017, 54, p. 103-112. ISSN 1201-9712

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  5. Ahuka-Mundeke S., Ayouba Ahidjo, Mbala-Kingebeni P., Foncelle C., Mubonga M., Ndimbo-Kumugo S. P., Lunguya-Metila O., Mbenzo-Abokome V., Muyembe-Tamfum J. J., Delaporte Eric, Peeters Martine. High prevalences and a wide genetic diversity of simian retroviruses in non-human primate bushmeat in rural areas of the Democratic Republic of Congo [+ Erratum]. Ecohealth, 2017, 14 (1), p. 100-114 + erratum. ISSN 1612-9202

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  6. Ahuka-Mundeke S., Mbala-Kingebeni P., Ndimbo-Kumogo S. P., Foncelle C., Lunguya-Metila O., Muyembe-Tamfum J. J., Delaporte Eric, Peeters Martine, Ayouba Ahidjo. Full genome characterization of a new simian immune deficiency virus lineage in a naturally infected cercopithecus ascanius whitesidei in the Democratic Republic of Congo reveals high genetic diversity among red-tailed monkeys in Central and Eastern Africa. AIDS Research and Human Retroviruses, 2017, 33 (7), p. 735-739. ISSN 0889-2229

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  7. Akakpo R., Scarcelli Nora, Chair H., Dansi A., Djedatin G., Thuillet Anne-Céline, Rhoné Bénédicte, Francois O., Alix K., Vigouroux Yves. Molecular basis of African yam domestication : analyses of selection point to root development, starch biosynthesis, and photosynthesis related genes. BMC Genomics, 2017, 18, p. art. 782 [9 p.]. ISSN 1471-2164

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  8. Alaya I., Masmoudi M.M., Lagacherie P., Coulouma G., Jacob Frédéric, Ben Mechlia N. Performance of Saxton and Rawls pedotransfer functions for estimating soil water properties in the Cap Bon region - Northern Tunisia. In : Ouessar M. (ed.), Gabriels D. (ed.), Tsunekawa A. (ed.), Evett S. (ed.) Water land security drylands : response to climate change. Cham : Springer, 2017, p. 77-85. ISBN 978-3-319-54020-7

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  9. Albaret Jean-Jacques. Fish communities in estuaries and lagoons. In : Paugy Didier (ed.), Lévêque Christian (ed.), Otero O. (ed.) The inland water fishes of Africa : diversity, ecology and human use. Marseille : IRD ; MRAC, 2017, p. 417-440. ISBN 978-2-7099-2400-9

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010071713

  10. Albuquerque E. V. S., Petitot Anne-Sophie, da Silva J. P., Grossi-de-Sa M. F., Fernandez Diana. Early responses of coffee immunity-related genes to root-knot nematode infection. Physiological and Molecular Plant Pathology, 2017, 100, p. 142-150. ISSN 0885-5765

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  11. Ali N., Tavoillot Johannes, Besnard G., Khadari B., Dmowska E., Winiszewska G., Fossati-Gaschignard O., Ater M., Hamza M. A., El Mousadik A., El Oualkadi A., Moukhli A., Essalouh L., El Bakkali A., Chapuis Elodie, Mateille Thierry. How anthropogenic changes may affect soil-borne parasite diversity ? Plant-parasitic nematode communities associated with olive trees in Morocco as a case study. BMC Ecology, 2017, 17, p. art. 4 [31 p.]. ISSN 1472-6785

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  12. Almar Rafael, Marchesiello Patrick, Almeida L.P., Duong Hai Thuan, Tanaka H., Nguyen Trung Viet. Shoreline response to a sequence of typhoon and monsoon events. In : Ouillon Sylvain (ed.). Sediment transport in coastal waters. Water, 2017, 9 (6 (no spécial)), art. 364 [8 p.] ISSN 2073-4441

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  13. Alou M. T., Million M., Traore S. I., Mouelhi D., Khelaifia S., Bachar D., Caputo A., Delerce J., Brah S., Alhousseini D., Sokhna Cheikh, Robert C., Diallo B. A., Diallo A., Parola P., Golden M., Lagier J. C., Raoult D. Gut bacteria missing in severe acute malnutrition, can we identify potential probiotics by culturomics ?. Frontiers in Microbiology, 2017, 8, p. art. 899 [17 p.]. ISSN 1664-302X

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  14. Alou M. T., Rathored J., Michelle C., Dubourg G., Andrieu C., Armstrong N., Sokhna Cheikh, Diallo A., Raoult D., Fournier P. E. Inediibacterium massiliense gen. nov., sp. nov., a new bacterial species isolated from the gut microbiota of a severely malnourished infant. Antonie Van Leeuwenhoek International = Journal of General and Molecular Microbiology, 2017, 110 (6), p. 737-750. ISSN 0003-6072

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  15. Alves dos Santos G.G., Oliveira M., Souza Miranda I., Mitja Danielle, Mafra N., Laques A.E. Efeitos da escala e configuração da paisagem sobre comunidades vegetais em uma paisagem antropizada no nordeste da Amazônia. Espacios, 2017, 38 (46), art. no 27 [16 p.] ISSN 0798-1015

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  16. Alves G. S. C., Torres L. F., Dechamp E., Breitler J. C., Joët Thierry, Gatineau F., Andrade A. C., Bertrand B., Marraccini P., Etienne H. Differential fine-tuning of gene expression regulation in coffee leaves by CcDREB1D promoter haplotypes under water deficit. Journal of Experimental Botany, 2017, 68 (11), p. 3017-3031. ISSN 0022-0957

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  17. Amanzougaghene N., Fenollar F., Sangare A. K., Sissoko M. S., Doumbo O. K., Raoult D., Mediannikov Oleg. Detection of bacterial pathogens including potential new species in human head lice from Mali. PLOS One, 2017, 12 (9), p. e0184621 [18 p.]. ISSN 1932-6203

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  18. Amazirh A., Er-Raki S., Chehbouni Abdelghani, Rivalland V., Diarra A., Khabba S., Ezzahar J., Merlin Olivier. Modified Penman-Monteith equation for monitoring evapotranspiration of wheat crop : relationship between the surface resistance and remotely sensed stress index. Biosystems Engineering, 2017, 164, p. 68-84. ISSN 1537-5110

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  19. Amsellem L., Brouat Carine, Duron O., Porter S. S., Vilcinskas A., Facon B. Importance of microorganisms to macroorganisms invasions : is the essential invisible to the eye ? (The Little Prince, A. de Saint-Exupery, 1943). In : Bohan D. A. (ed.), Dumbrell A. J. (ed.), Massol F. (ed.) Networks of invasion : empirical evidence and case studies . Advances in Ecological Research, 2017, 57, p. 99-146.

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  20. Amziane M., Darenfed-Bouanane A., Abderrahmani A., Selama O., Jouadi L., Cayol J. L., Nateche F., Fardeau Marie-Laure. Virgibacillus ainsalahensis sp. nov., a moderately halophilic bacterium isolated from sediment of a saline lake in south of Algeria. Current Microbiology, 2017, 74 (2), p. 219-223. ISSN 0343-8651

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  21. Anthelme Fabien, Meneses R. I., Valero N. N. H., Pozo P., Dangles Olivier. Fine nurse variations explain discrepancies in the stress-interaction relationship in alpine regions. Oikos, 2017, 126 (8), p. 1173-1183. ISSN 0030-1299

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  22. Archundia D., Duwig Céline, Spadini L., Uzu Gaëlle, Guédron Stéphane, Morel M. C., Cortez R., Ramos O. R., Chincheros J., Martins J. M. F. How uncontrolled urban expansion increases the contamination of the Titicaca Lake Basin (El Alto, La Paz, Bolivia). Water Air and Soil Pollution, 2017, 228 (1), p. art. 44 [ p.]. ISSN 0049-6979

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  23. Assefa Y., Goftishu M., Capdevielle Dulac Claire, Le Rü Bruno. Clarifying the source of Conicofrontia sesamoides Hampson (Lepidoptera : Noctuidae) population in South African sugarcane using morphological identification and mitochondrial DNA analysis. Phytoparasitica, 2017, 45 (1), p. 45-55. ISSN 0334-2123

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  24. Assouma M. H., Serca D., Guérin Frédéric, Blanfort V., Lecomte P., Toure I., Ickowicz A., Manlay R. J., Bernoux Martial, Vayssieres J. Livestock induces strong spatial heterogeneity of soil CO2, N2O and CH4 emissions within a semi-arid sylvo-pastoral landscape in West Africa. Journal of Arid Land, 2017, 9 (2), p. 210-221. ISSN 1674-6767

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  25. Aubertin Catherine, Pons S. Politiques de développement durable en Guyane : souveraineté sur les ressources forestières. In : Olagnier P.J. (coord.) La Guyane : enjeux internationaux, adaptations locales. Territoire en Mouvement, 2017, (36), p. 1-20. ISSN 1950-5698

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  26. Auer L., Lazuka A., Sillam-Dussès David, Miambi E., O'Donohue M., Hernandez-Raquet G. Uncovering the potential of termite gut microbiome for lignocellulose bioconversion in anaerobic batch bioreactors. Frontiers in Microbiology, 2017, 8, p. art. 2623 [14 p.]. ISSN 1664-302X

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  27. Awessou K. G. B., Peugeot Christophe, Rocheteau Alain, Séguis Luc, Do Frédéric, Galle Sylvie, Bellanger M., Agbossou E., Seghieri Josiane. Differences in transpiration between a forest and an agroforestry tree species in the Sudanian belt. Agroforestry Systems, 2017, 91 (3), p. 403-413. ISSN 0167-4366

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010070226 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  28. Ayhan N., Baklouti A., Prudhomme Jorian, Walder G., Amaro F., Alten B., Moutailler S., Ergunay K., Charrel R. N., Huemer H. Practical guidelines for studies on sandfly-borne phleboviruses : Part I. Important points to consider ante field work. Vector-Borne and Zoonotic Diseases, 2017, 17 (1), p. 73-80. ISSN 1530-3667

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  29. Ayyoub A., Er-Raki S., Khabba S., Merlin Olivier, Ezzahar J., Rodriguez J. C., Bahlaoui A., Chehbouni Abdelghani. A simple and alternative approach based on reference evapotranspiration and leaf area index for estimating tree transpiration in semi-arid regions. Agricultural Water Management, 2017, 188, p. 61-68. ISSN 0378-3774

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010070069 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  30. Bacaër Nicolas. Sur la vitesse d’extinction d’une population dans un environnement aléatoire. Comptes Rendus Biologies, 2017, 340 (5), p. 259-263. ISSN 1631-0691

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010070087 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  31. Badshah H., Ullah F., Calatayud Paul-André, Ullah H., Ahmad B. Can toxicants used against cotton mealybug Phenacoccus solenopsis be compatible with an encyrtid parasitoid Aenasius bambawalei under laboratory conditions ?. Environmental Science and Pollution Research, 2017, 24 (6), p. 5857-5867. ISSN 0944-1344

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  32. Badshah H., Ullah F., Zada H., Zeb Q., Shah R. A., Calatayud Paul-André, Crickmore N. Comparison of Phenacoccus solenopsis specimens from different regions of Pakistan using COI molecular barcoding (Hemiptera : Pseudococcidae). Annales de la Société Entomologique de France, 2017, 53 (6), p. 374-378. ISSN 0037-9271

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  33. Bahir M., Boulet Gilles, Olioso A., Rivalland V., Gallego-Elvira B., Mira M., Rodriguez J. C., Jarlan Lionel, Merlin Olivier. Evaluation and aggregation properties of thermal infra-red-based evapotranspiration algorithms from 100 m to the km scale over a semi-arid irrigated agricultural area. Remote Sensing, 2017, 9 (11), p. art. 1178 [27 p.]. ISSN 2072-4292

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  34. Barbosa A. N., Boyer L., Chippaux Jean-Philippe, Medolago N. B., Caramori C. A., Paixao A. G., Poli J. P. V., Mendes M. B., dos Santos L. D., Ferreira R. S., Barraviera B. A clinical trial protocol to treat massive Africanized honeybee (Apis mellifera) attack with a new apilic antivenom. Journal of Venomous Animals and Toxins Including Tropical Diseases, 2017, 23 (1), p. art. 14 [10 p.]. ISSN 1678-9199

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  35. Barnaud Adeline, Vigouroux Yves, Diallo M. T., Saidou S. I., Piquet M., Barry M. B., Bakasso Y., Zekraoui Leila, Rivallan R., Kane N. A., Billot C. High selfing rate inferred for white fonio [Digitaria exilis (Kippist.) Stapf] reproductive system opens up opportunities for breeding programs. Genetic Resources and Crop Evolution, 2017, 64 (7), p. 1485-1490. ISSN 0925-9864

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  36. Barot Sébastien, Allard V., Cantarel A., Enjalbert J., Gauffreteau A., Goldringer I., Lata J. C., Le Roux X., Niboyet A., Porcher E. Designing mixtures of varieties for multifunctional agriculture with the help of ecology : a review. Agronomy for Sustainable Development, 2017, 37 (2), p. art. 13 [20 p.]. ISSN 1774-0746

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  37. Barot Sébastien, Ye L., Abbadie L., Blouin M., Frascaria-Lacoste N. Ecosystem services must tackle anthropized ecosystems andecological engineering. Ecological Engineering, 2017, 99, p. 486-495. ISSN 0925-8574

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010068897 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  38. Barraza F., Schreck E., Leveque T., Uzu Gaëlle, Lopez F., Ruales J., Prunier J., Marquet A., Maurice Laurence. Cadmium bioaccumulation and gastric bioaccessibility in cacao : a field study in areas impacted by oil activities in Ecuador. Environmental Pollution, 2017, 229, p. 950-963. ISSN 0269-7491

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010070985 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  39. Barreto Perdigão de Oliveira S., Benício de Souza Carvalho M.S., Sifeddine Abdelfettah, Ferraz B., Passos Rodrigues Martins E.S. Usa de sensoriamento remoto para mapeamento de areas suscetiveis a desertificaçao na regiao semiarida do Brasil. Ciência e Trópico, 2017, 41 (2), p. 67-96. ISSN 0304-2685

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  40. Barrière Olivier. Les milieux ouverts et le droit : le pastoralisme dans les territoires. In : Terres pastorales : diversité et valeurs des milieux ouverts méditerranéens. 2017, p. 106-110. ISBN 978-2-8126-1281-7

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010072550 Accès réservé (Intranet IRD)

  41. Barrière Q., Guefrachi I., Gully Djamel, Lamouche F., Pierre O., Fardoux Joël, Chaintreuil Clémence, Alunni B., Timchenko T., Giraud Eric, Mergaert P. Integrated roles of BclA and DD-carboxypeptidase 1 in Bradyrhizobium differentiation within NCR-producing and NCR-lacking root nodules. Scientific Reports - Nature, 2017, 7, p. art. 9063 [13 p.]. ISSN 2045-2322

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010070939 Lien chez l'éditeur Fichier au format PDF

  42. Barthe S., Binelli G., Herault B., Scotti-Saintagne C., Sabatier Daniel, Scotti I. Tropical rainforests that persisted : inferences from the Quaternary demographic history of eight tree species in the Guiana shield. Molecular Ecology, 2017, 26 (4), p. 1161-1174. ISSN 0962-1083

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010069386 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  43. Battude M., Al Bitar A., Brut A., Tallec T., Huc M., Cros J., Weber J. J., Lhuissier L., Simonneaux Vincent, Demarez V. Modeling water needs and total irrigation depths of maize crop in the south west of France using high spatial and temporal resolution satellite imagery. Agricultural Water Management, 2017, 189, p. 123-136. ISSN 0378-3774

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010070259 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  44. Baudou F. G., Litwin S., Lanari L. C., Laskowicz R. D., Damin C. F., Chippaux Jean-Philippe, de Roodt A. R. Antivenom against Crotalus durissus terrificus venom : immunochemical reactivity and experimental neutralizing capacity. Toxicon, 2017, 140, p. 11-17. ISSN 0041-0101

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010071903 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  45. Belot J.L. (ed.), Andrade Vilela P.M.C. (ed.), Silvie Pierre (collab.). Compendio de identificaçao : problemas agronomicos em algododeiro e ferramentas de controle. Ciuaba : IMAmt, 2017, 303 p. ISBN 978-85-66657-12-4

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010071770

  46. Ben Hania W., Joseph Manon, Bunk B., Sproer C., Klenk H. P., Fardeau Marie-Laure, Spring S. Characterization of the first cultured representative of a Bacteroidetes clade specialized on the scavenging of cyanobacteria. Environmental Microbiology, 2017, 19 (3), p. 1134-1148. ISSN 1462-2912

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010069416 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  47. Benacer D., Thong K. L., Ooi P. T., Souris Marc, Lewis J. W., Ahmed A. A., Zain S. N. M. Serological and molecular identification of Leptospira spp. in swine and stray dogs from Malaysia. Tropical Biomedicine, 2017, 34 (1), p. 89-97. ISSN 0127-5720

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010069460 Accès réservé (Intranet IRD)

  48. Benkhoua N., Hafidi M., Badri W., Baudoin Ezékiel, Thioulouse J., Prin Y., Galiana A., Ouahmane L., Ouhammou A., Sanguin H., Duponnois Robin. Management of the mycorrhizal soil infectivity with Crotalaria ochroleuca, an indigenous wild legume in the tropics: Impacts on microbial functional diversity involved in phosphorus mobilizationprocesses in a sahelian soil. Ecological Engineering, 2017, 101, p. 130-136. ISSN 0925-8574

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010069488 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  49. Benoist R., Chantre C., Capdevielle Dulac Claire, Bodet M., Mougel F., Calatayud Paul-André, Dupas Stéphane, Huguet E., Jeannette Rémi, Obonyo J., Odorico C., Silvain Jean-François, Le Rü Bruno, Kaiser L. Relationship between oviposition, virulence gene expression and parasitism success in Cotesia typhae nov. sp. parasitoid strains. Genetica, 2017, 145 (6), p. 469-479. ISSN 0016-6707

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010071395 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  50. Benzoni Francesca, Houlbrèque Fanny, André Laure Vaitiare, Payri Claude. Plan d'action rapide et adaptatif, en cas de blanchissement corallien : le cas de la Nouvelle-Calédonie, épisode 2016 : synthèse. Nouméa : IRD, 2017, (67), 90 p. multigr. (Sciences de la Mer.Biologie Marine.Rapports Scientifiques et Techniques ; 67).

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  51. Bertrand Sophie, Barbraud C. Les oiseaux marins. In : Euzen A. (dir.), Gaill F. (dir.), Lacroix D. (dir.), Cury Philippe (dir.). L'océan à découvert. Paris : CNRS, 2017, p. 94-95. (A Découvert). ISBN 978-2-271-11652-9

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  52. Bertrand Sophie, Barbraud C. Seabirds. In : Euzen A. (ed.), Gaill F. (ed.), Lacroix D. (ed.), Cury Philippe (ed.). The Ocean revealed. Paris : CNRS, 2017, p. 94-95. ISBN 978-2-271-11907-0

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