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Publications des scientifiques de l'IRD

2016 - Articles

  1. Aaby P., Nielsen J., Benn C. S., Trape Jean-François. Sex-differential effects on mortality of BCG and diphtheria-tetanus-pertussis vaccines in a rural area with high vaccination coverage : observational study from Senegal. Transactions of the Royal Society of Tropical Medicine and Hygiene, 2016, 110 (9), p. 527-533. ISSN 0035-9203

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  2. Abadie E., Muguet A., Berteaux T., Chomerat N., Hess P., D'OrbCastel E. R., Masseret Estelle, Laabir Mohamed. Toxin and growth responses of the neurotoxic dinoflagellate Vulcanodinium rugosum to varying temperature and salinity. Toxins, 2016, 8 (5), p. art. 136 [18 p.]. ISSN 2072-6651

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  3. Abat C., Chaudet H., Rolain J. M., Colson P., Raoult Didier. Traditional and syndromic surveillance of infectious diseases and pathogens. International Journal of Infectious Diseases, 2016, 48, p. 22-28. ISSN 1201-9712

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  4. Abat C., Huart M., Garcia V., Dubourg G., Raoult Didier. Enterococcus faecalis urinary-tract infections : do they have a zoonotic origin ?. Journal of Infection, 2016, 73 (4), p. 305-313. ISSN 0163-4453

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  5. Abat C., Raoult Didier, Rolain J. M. Decreasing level of resistance in invasive Klebsiella pneumoniae strains isolated in Marseille, January 2012-July 2015. Springerplus, 2016, 5, p. art. 631. ISSN 2193-1801

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  6. Abat C., Raoult Didier, Rolain J. M. Low level of resistance in enterococci isolated in four hospitals, Marseille, France. Microbial Drug Resistance, 2016, 22 (3), p. 218-222. ISSN 1076-6294

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  7. Abat Cédric, Colson P., Chaudet H., Rolain J. M., Bassene H., Diallo A., Mediannikov Oleg, Fenollar F., Raoult D., Sokhna Cheikh. Implementation of syndromic surveillance ystems in two rural villages in Senegal. Plos Neglected Tropical Diseases, 2016, 10 (12), p. e0005212 [12 p.]. ISSN 1935-2735

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  8. Abdalla K., Chivenge P., Ciais P., Chaplot Vincent. No-tillage lessens soil CO2 emissions the most under arid and sandy soil conditions : results from a meta-analysis. Biogeosciences, 2016, 13 (12), p. 3619-3633. ISSN 1726-4170

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  9. Abdalla K., Chivenge P., Everson C., Mathieu O., Thevenot M., Chaplot Vincent. Long-term annual burning of grassland increases CO2 emissions from soils. Geoderma, 2016, 282, p. 80-86. ISSN 0016-7061

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  10. Abdou K., Halouani G., Hattab T., Romdhane M. S., Lasram F. B., Le Loc'h François. Exploring the potential effects of marine protected areas on the ecosystem structure of the Gulf of Gabes using the Ecospace model. Aquatic Living Resources, 2016, 29 (2), p. art. 202 [18 p.]. ISSN 0990-7440

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  11. Abdulla S., Achan J., Adam I., Alemayehu B. H., Allan R., Allen E. N., Anvikar A. R., Arinaitwe E., Ashley E. A., Asih P. B. S., Awab G. R., Barnes K. I., Bassat Q., Baudin E., Bjorkman A., Bompart F., Bonnet Maryline, Borrmann S., Bousema T., Carrara V. I., Cenci F., Checchi F., Cot Michel, Dahal P., D'Alessandro U., Deloron Philippe, et al.. Gametocyte carriage in uncomplicated Plasmodium falciparum malaria following treatment with artemisinin combination therapy: a systematic review and meta-analysis of individual patient data. BMC Medicine, 2016, 14, p. art. 79 [18 p.]. ISSN 1741-7015

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  12. Abessolo Ondoa G., Almar Rafaël, Kestenare Elodie, Bahini A., Houngue G. H., Jouanno Julien, Penhoat du Yves, Castelle B., Melet A., Meyssignac B., Anthony E. J., Laibi R., Alory Gaël, Ranasinghe R. Potential of video cameras in assessing event and seasonal coastline behaviour : Grand Popo, Benin (Gulf of Guinea). Journal of Coastal Research, 2016, (no spécial 75), p. 442-446. International Coastal Symposium (ICS), 14., Sydney, 2016/03/06-11. ISSN 0749-0208

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  13. Absi Pascale (dir.), Geffroy C. (dir.) Intimidades políticas : interpelaciones al sexo y a la sexualidad desde Bolivia. Bulletin de l'Institut Français d'Etudes Andines, 2016, 45 (3), p. 361-461 [en ligne]. ISSN 2076-5827

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  14. Absi Pascale, Bazin L., Selim Monique. The knotted web of denominations : epistemological investment in the anthropology of work. World Journal of Social Science Research, 2016, 3 (3), p. 396-417. ISSN 2375-9747

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  15. Absi Pascale, Geffroy C. Intimidades políticas : preambulo. In : Absi Pascale (dir.), Geffroy C. (dir.) Intimidades políticas : interpelaciones al sexo y a la sexualidad desde Bolivia. Bulletin de l'Institut Français d'Etudes Andines, 2016, 45 (3), p. 361-362 [en ligne]. ISSN 2076-5827

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  16. Absi Pascale. Hablando de sexo. In : Absi Pascale (dir.), Geffroy C. (dir.) Intimidades políticas : interpelaciones al sexo y a la sexualidad desde Bolivia. Bulletin de l'Institut Français d'Etudes Andines, 2016, 45 (3), p. 363-372 [en ligne]. ISSN 2076-5827

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  17. Achite M., Ouillon Sylvain. Recent changes in climate, hydrology and sediment load in the Wadi Abd, Algeria (1970-2010). Hydrology and Earth System Sciences, 2016, 20 (4), p. 1355-1372. ISSN 1027-5606

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  18. Adamou R., Chenou F., Sadissou I., Sonon P., Dechavanne C., Djilali-Saiah A., Cottrell Gilles, Le Port A., Massougbodji A., Remarque E. J., Luty Adrian, Sanni A., Garcia André, Migot Nabias Florence, Milet Jacqueline, Courtin David. Plasmodium falciparum infection and age influence parasite growth inhibition mediated by IgG in Beninese infants. Acta Tropica, 2016, 159, p. 111-119. ISSN 0001-706X

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  19. Adde A., Dusfour I., Roux Emmanuel, Girod R., Briolant S. Anopheles fauna of coastal Cayenne, French Guiana: modelling and mapping of species presence using remotely sensed land cover data. Memorias do Instituto Oswaldo Cruz, 2016, 111 (12), p. 750-756. ISSN 0074-0276

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  20. Adde A., Roucou P., Mangeas Morgan, Ardillon V., Desenclos J. C., Rousset D., Girod R., Briolant S., Quenel P., Flamand C. Predicting dengue fever outbreaks in French Guiana using climate indicators. Plos Neglected Tropical Diseases, 2016, 10 (4), p. e0004681 [16 p.]. ISSN 1935-2735

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  21. Adde A., Roux Emmanuel, Mangeas Morgan, Dessay Nadine, Nacher M., Dusfour I., Girod R., Briolant S. Dynamical mapping of Anopheles darlingi densities in a residual malaria transmission area of French Guiana by using remote sensing and meteorological data. Plos One, 2016, 11 (10), p. e0164685 [20 p.]. ISSN 1932-6203

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  22. Addisalem A.B., Duminil Jérôme, Wouters D., Bongers F., Smulders M.J.M. Fine-scale spatial genetic structure in the frankincense tree Boswellia papyrifera (Del.) Hochst. and implications for conservation. Tree Genetics and Genomes, 2016, 12, art. no 86 [10 p.] ISSN 0378-1127

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  23. Adjamagbo Agnès, Gastineau Bénédicte, Kpadonou N. Travail-famille : un défi pour les femmes à Cotonou. In : Gomez-Perez M. (introd.), Brossier M. (introd.) Négocier et habiter les normes sociales en Afrique au sud du Sahara. Recherches Féministes, 2016, 29 (2), p. 17-41. ISSN 1705-9240

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  24. Adjamagbo Agnès. Récits de vie de jeunes filles rurales dans l'Ouest ivoirien : les rapports de genre ont une histoire. In : Gastineau Bénédicte (ed.), Golaz V. (ed.) Être jeune en Afrique rurale [dossier]. Afrique contemporaine, 2016, 259, p. 126-128. ISSN 0002-0478

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  25. Adjeroud Mehdi, Gilbert A., Facon M., Foglia M., Moreton B., Heintz T. Localised and limited impact of a dredging operation on coral cover in the northwestern lagoon of New Caledonia. Marine Pollution Bulletin, 2016, 105 (1), p. 208-214. ISSN 0025-326X

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  26. Adjeroud Mehdi, Wallace C. C., Bosserelle P., Payri Claude, Menou J. L., Pichon M. Reefs at the edge : coral community structure around Rapa, southernmost French Polynesia. Marine Ecology : an Evolutionary Perspective, 2016, 37 (3), p. 565-575. ISSN 0173-9565

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  27. Adler S., Mouille G., Fock-Bastide I., Citerne S., Noirot Michel. Comparison between Coffea arabica L. 'Laurina' and C. arabica 'Bourbon' seedlings grown in daylight or darkness for their polysaccharidic cell wall composition and caffeine and chlorogenic acid contents. Trees : Structure and Function, 2016, 30 (3), p. 665-674. ISSN 0931-1890

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  28. Adrian-Martiez S., Albert A., Andre M., Anton G., Ardid M., Aubert J. J., Avgitas T., Baret B., Barrios-Marti J., Basa S., Bertin V., Biagi S., Bormuth R., Bou-Cabo M., Bouwhuis M. C., Bruijn R., Brunner J., Busto J., Capone A., Caramete L., Carr J., Celli S., Chiarusi T., Circella M., Coleiro A., Coniglione R., Costantini H., Coyle P., Creusot A., Deschamps A., De Bonis G., Distefano C., Donzaud C., Dornic D., Drouhin D., Eberl T., El Bojaddaini I., Elsasser D., Enzenhofer A., Fehn K., Felis I., Fusco L. A., Galata S., Gay P., Geisselsoder S., Geyer K., Giordano V., Gleixner A., Glotin H., Gracia-Ruiz R., Graf K., Hallmann S., van Haren H., Heijboer A. J., Hello Yann, et al.. A search for secluded dark matter in the Sun with the ANTARES neutrino telescope. Journal of Cosmology and Astroparticle Physics, 2016, (5), art. 016 [13 p.] ISSN 1475-7516

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  29. Adrian-Martinez S. (collab.), Hello Yann (collab.), Antares Collaboration, IceCube Collaboration, Ligo Sci Collaboration, Virgo Collaboration, et al. High-energy neutrino follow-up search of gravitational wave event GW150914 with ANTARES and IceCube. Physical Review D, 2016, 93 (12), p. art. 122010 (15 p.]. ISSN 2470-0010

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  30. Adrian-Martinez S., Ageron M., Albert A., Al Samarai I., Andre M., Anton G., Ardid M., Aubert J. J., Baret B., Barrios-Marti J., Basa S., Bertin V., Biagi S., Bogazzi C., Bormuth R., Bou-Cabo M., Bouwhuis M. C., Bruijnk R., Brunner J., Busto J., Capone A., Caramete L., Carr J., Chiarusi T., Circella M., Coniglione R., Costantini H., Coyle P., Creusot A., Dekeyser I., Deschamps A., Bonis G., Distefano C., Donzaud C., Dornic D., Drouhin D., Dumas A., Eberl T., Elsasser D., Enzenhofer A., Fehn K., Feis I., Fermani P., Folger F., Fusco L. A., Galata S., Gay P., Geisselsoder S., Geyer K., Giordano V., Gleixner A., Gracia-Ruiz R., Graf K., van Haren H., Heijboer A. J., Hello Yann, et al. Optical and X-ray early follow-up of ANTARES neutrino alerts. Journal of Cosmology and Astroparticle Physics, 2016, (2), p. 062. ISSN 1475-7516

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  31. Adrian-Martinez S., Albert A., Andre M., Anghinolfi M., Anton G., Ardid M., Aubert J. J., Avgitas T., Baret B., Barrios-Marti J., Basa S., Bertin V., Biagi S., Bormuth R., Bouwhuis M. C., Bruijn R., Brunner J., Busto J., Capone A., Caramete L., Carr J., Celli S., Chiarusi T., Circella M., Coleiro A., Coniglione R., Costantini H., Coyle P., Creusot A., Deschamps A., De Bonis G., Distefano C., Donzaud C., Dornic D., Drouhin D., Eberl T., El Bojaddaini I., Elsasser D., Enzenhofer A., Fehn K., Felis I., Fusco L. A., Galata S., Gay P., Geisselsoder S., Geyer K., Giordano V., Gleixner A., Glotin H., Gracia-Ruiz R., Graf K., Hallmann S., van Haren H., Heijboer A. J., Hello Yann, et al.. Constraints on the neutrino emission from the Galactic Ridge with the ANTARES telescope. Physics Letters B, 2016, 760, p. 143-148. ISSN 0370-2693

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  32. Adrian-Martinez S., Albert A., Andre M., Anton G., Ardid M., Aubert J. J., Baret B., Barrios-Marti J., Basa S., Bertin V., Biagi S., Bogazzi C., Bormuth R., Bou-Cabo M., Bouwhuis M. C., Bruijn R., Brunner J., Busto J., Capone A., Caramete L., Carr J., Chiarusi T., Circella M., Coniglione R., Costantini H., Coyle P., Creusot A., Dekeyser I., Deschamps A., De Bonis G., Distefano C., Donzaud C., Dornic D., Drouhin D., Dumas A., Eberl T., Elsasser D., Enzenhofer A., Fehn K., Felis I., Fermani P., Flaminio V., Folger F., Fusco L. A., Galata S., Gay P., Geisselsoder S., Geyer K., Giordano V., Gleixner A., Gracia-Ruiz R., Gomez-Gonzalez J. P., Graf K., van Haren H., Heijboer A. J., Hello Yann, Hernandez-Rey J. J., Herrero A., Hossl J., Hofestadt J., Hugon C., James C. W., de Jong M., Kadler M., Kalekin O., Katz U., Kiessling D., Kooijman P., Kouchner A., Kreykenbohm I., Kulikovskiy V., Lahmann R., Lambard G., Lattuada D., Lefevre D., Leonora E., Loucatos S., Mangano S., Marcelin M., Margiotta A., Marinelli A., Martinez-Mora J. A., Martini Séverine, et al. Time calibration with atmospheric muon tracks in the ANTARES neutrino telescope. Astroparticle Physics, 2016, 78, p. 43-51. ISSN 0927-6505

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  33. Adrian-Martinez S., Albert A., Andre M., Anton G., Ardid M., Aubert J. J., Baret B., Barrios-Marti J., Basa S., Bertin V., Biagi S., Bormuth R., Bouwhuis M. C., Bruijn R., Brunner J., Busto J., Capone A., Caramete L., Carr J., Chiarusi T., Circella M., Coniglione R., Costantini H., Coyle P., Creusot A., Dekeyser I., Deschamps A., De Bonis G., Distefano C., Donzaud C., Dornic D., Drouhin D., Dumas A., Eberl T., Elsasser D., Enzenhofer A., Fehn K., Felis I., Fermani P., Folger F., Fusco L. A., Galata S., Gay P., Geisselsoder S., Geyer K., Giordano V., Gleixner A., Gracia-Ruiz R., Graf K., Hallmann S., van Haren H., Heijboer A. J., Hello Yann, et al.. The first combined search for neutrino point-sources in the southern hemisphere with the ANTARES and IceCube neutrino telescopes. Astrophysical Journal, 2016, 823 (1), p. art. 65 [12 p.]. ISSN 0004-637X

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  34. Adrian-Martineza S., Albert A., Andre M., Anton G., Ardid M., Aubert J. J., Avgitas T., Baret B., Barrios-Marti J., Basa S., Bertin V., Biagi S., Bormuth R., Bouwhuis M. C., Bruijn R., Brunner J., Busto J., Capone A., Caramete L., Carr J., Celli S., Chiarusi T., Circella M., Coleiro A., Coniglione R., Costantini H., Coyle P., Creusot A., Deschamps A., De Bonis G., Distefano C., Donzaud C., Dornic D., Drouhin D., Eberl T., El Bojaddaini I., Elsasser D., Enzenhofer A., Fehn K., Felis I., Fusco L. A., Galata S., Gay P., Geisselsoder S., Geyer K., Giordano V., Gleixner A., Glotin H., Gracia-Ruiz R., Graf K., Hallmann S., van Haren H., Heijboer A. J., Hello Yann, et al.. Limits on dark matter annihilation in the sun using the ANTARES neutrino telescope. Physics Letters B, 2016, 759, p. 69-74. ISSN 0370-2693

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  35. Adriani D. E., Dingkuhn M., Dardou A., Adam Hélène, Luquet D., Lafarge T. Rice panicle plasticity in Near Isogenic Lines carrying a QTL for larger panicle is genotype and environment dependent. Rice, 2016, 9, p. art. 28 [15 p.]. ISSN 1939-8425

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010067614 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  36. Aeby G., Tribollet Aline, Lasne G., Work T. Assessing threats from coral and crustose coralline algae disease on the reefs of New Caledonia. Marine and Freshwater Research, 2016, 67 (4), p. 455-465. ISSN 1323-1650

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010066718 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  37. Affeldt S., Sokolovska N., Prifti E., Zucker Jean-Daniel. Spectral consensus strategy for accurate reconstruction of large biological networks. BMC Bioinformatics, 2016, 17 (16), p. art. 493 [13 p.]. ISSN 1471-2105

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  38. Afolabi O., Amoussa R., Bile M., Oludare A., Gbogbo V., Poulin Lucie, Koebnik Ralf, Szurek Boris, Silue D. First report of bacterial leaf blight of rice caused by Xanthomonas oryzae pv. oryzae in Benin. Plant Disease, 2016, 100 (2), p. 515-515. ISSN 0191-2917

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  39. Afonso C. L., Amarasinghe G. K., Banyai K., Bao Y. M., Basler C. F., Bavari S., Bejerman N., Blasdell K. R., Briand F. X., Briese T., Bukreyev A., Calisher C. H., Chandran K., Cheng J. S., Clawson A. N., Collins P. L., Dietzgen R. G., Dolnik O., Domier L. L., Durrwald R., Dye J. M., Easton A. J., Ebihara H., Farkas S. L., Freitas-Astua J., Formenty P., Fouchier R. A. M., Fu Y. P., Ghedin E., Goodin M. M., Hewson R., Horie M., Hyndman T. H., Jiang D. H., Kitajima E. W., Kobinger G. P., Kondo H., Kurath G., Lamb R. A., Lenardon S., Leroy Eric, Li C. X., Lin X. D., Liu L. J., Longdon B., Marton S., Maisner A., Muhlberger E., Netesov S. V., Nowotny N., Patterson J. L., Payne S. L., Paweska J. T., Randall R. E., Rima B. K., Rota P., Rubbenstroth D., Schwemmle M., Shi M., Smither S. J., Stenglein M. D., Stone D. M., Takada A., Terregino C., Tesh R. B., Tian J. H., Tomonaga K., Tordo N., Towner J. S., Vasilakis N., Verbeek M., Volchkov V. E., Wahl-Jensen V., Walsh J. A., Walker P. J., Wang D., Wang L. F., Wetzel T., Whitfield A. E., Xie J. T., Yuen K. Y., Zhang Y. Z., Kuhn J. H. Taxonomy of the order Mononegavirales : update 2016. Archives of Virology, 2016, 161 (8), p. 2351-2360. ISSN 0304-8608

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  40. Agier Michel. Epistemological decentring : at the root of a contemporary and situational anthropology. Anthropological Theory, 2016, 16 (1), p. 22-47. ISSN 1463-4996

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010066652 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  41. Ago E. E., Agbossou E. K., Cohard J. M., Galle Sylvie, Aubinet M. Response of CO2 fluxes and productivity to water availability in two contrasting ecosystems in northern Benin (West Africa). Annals of Forest Science, 2016, 73 (2), p. 483-500. ISSN 1286-4560

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  42. Aherfi S., Colson P., Audoly G., Nappez C., Xerri L., Valensi A., Million M., Lepidi H., Costello R., Raoult Didier. Marseillevirus in lymphoma : a giant in the lymph node. Lancet Infectious Diseases, 2016, 16 (10), p. E225-E234. ISSN 1473-3099

    http://www.documentation.ird.fr/hor/PAR00015086 Lien chez l'éditeur

  43. Aherfi S., Colson P., La Scola B., Raoult Didier. Giant viruses of amoebas : an update. Frontiers in Microbiology, 2016, 7, p. art. 349. ISSN 1664-302X

    http://www.documentation.ird.fr/hor/PAR00014415 Lien chez l'éditeur

  44. Aherfi S., Colson P., Raoult Didier. Marseillevirus in the pharynx of a patient with neurologic disorders. Emerging Infectious Diseases, 2016, 22 (11), p. 2008-2010. ISSN 1080-6040

    http://www.documentation.ird.fr/hor/PAR00015234 Lien chez l'éditeur

  45. Ahmat A.M., Boussafir M., Le Milbeau C., Guegan R., Valdes J., Guinez M., Sifeddine Abdelfettah, Le Forestier L. Organic matter-clay interaction along a seawater column of the Eastern Pacific upwelling system (Antofagasta bay, Chile) : implications for source rock organic matter preservation. Marine Chemistry, 2016, 179, p. 23-33. ISSN 0304-4203

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