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Publications des scientifiques de l'IRD

2016 - Généralités / Sciences fondamentales et techniques - Articles

  1. Abdalla K., Chivenge P., Ciais P., Chaplot Vincent. No-tillage lessens soil CO2 emissions the most under arid and sandy soil conditions : results from a meta-analysis. Biogeosciences, 2016, 13 (12), p. 3619-3633. ISSN 1726-4170

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  2. Achite M., Ouillon Sylvain. Recent changes in climate, hydrology and sediment load in the Wadi Abd, Algeria (1970-2010). Hydrology and Earth System Sciences, 2016, 20 (4), p. 1355-1372. ISSN 1027-5606

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  3. Adde A., Dusfour I., Roux Emmanuel, Girod R., Briolant S. Anopheles fauna of coastal Cayenne, French Guiana: modelling and mapping of species presence using remotely sensed land cover data. Memorias do Instituto Oswaldo Cruz, 2016, 111 (12), p. 750-756. ISSN 0074-0276

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  4. Adde A., Roucou P., Mangeas Morgan, Ardillon V., Desenclos J. C., Rousset D., Girod R., Briolant S., Quenel P., Flamand C. Predicting dengue fever outbreaks in French Guiana using climate indicators. Plos Neglected Tropical Diseases, 2016, 10 (4), p. e0004681 [16 p.]. ISSN 1935-2735

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  5. Adde A., Roux Emmanuel, Mangeas Morgan, Dessay Nadine, Nacher M., Dusfour I., Girod R., Briolant S. Dynamical mapping of Anopheles darlingi densities in a residual malaria transmission area of French Guiana by using remote sensing and meteorological data. Plos One, 2016, 11 (10), p. e0164685 [20 p.]. ISSN 1932-6203

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  6. Adler S., Mouille G., Fock-Bastide I., Citerne S., Noirot Michel. Comparison between Coffea arabica L. 'Laurina' and C. arabica 'Bourbon' seedlings grown in daylight or darkness for their polysaccharidic cell wall composition and caffeine and chlorogenic acid contents. Trees : Structure and Function, 2016, 30 (3), p. 665-674. ISSN 0931-1890

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  7. Adrian-Martinez S. (collab.), Hello Yann (collab.), Antares Collaboration, IceCube Collaboration, Ligo Sci Collaboration, Virgo Collaboration, et al. High-energy neutrino follow-up search of gravitational wave event GW150914 with ANTARES and IceCube. Physical Review D, 2016, 93 (12), p. art. 122010 (15 p.]. ISSN 2470-0010

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  8. Adrian-Martinez S., Ageron M., Albert A., Al Samarai I., Andre M., Anton G., Ardid M., Aubert J. J., Baret B., Barrios-Marti J., Basa S., Bertin V., Biagi S., Bogazzi C., Bormuth R., Bou-Cabo M., Bouwhuis M. C., Bruijnk R., Brunner J., Busto J., Capone A., Caramete L., Carr J., Chiarusi T., Circella M., Coniglione R., Costantini H., Coyle P., Creusot A., Dekeyser I., Deschamps A., Bonis G., Distefano C., Donzaud C., Dornic D., Drouhin D., Dumas A., Eberl T., Elsasser D., Enzenhofer A., Fehn K., Feis I., Fermani P., Folger F., Fusco L. A., Galata S., Gay P., Geisselsoder S., Geyer K., Giordano V., Gleixner A., Gracia-Ruiz R., Graf K., van Haren H., Heijboer A. J., Hello Yann, et al. Optical and X-ray early follow-up of ANTARES neutrino alerts. Journal of Cosmology and Astroparticle Physics, 2016, (2), p. 062. ISSN 1475-7516

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  9. Adrian-Martinez S., Albert A., Andre M., Anton G., Ardid M., Aubert J. J., Baret B., Barrios-Marti J., Basa S., Bertin V., Biagi S., Bogazzi C., Bormuth R., Bou-Cabo M., Bouwhuis M. C., Bruijn R., Brunner J., Busto J., Capone A., Caramete L., Carr J., Chiarusi T., Circella M., Coniglione R., Costantini H., Coyle P., Creusot A., Dekeyser I., Deschamps A., De Bonis G., Distefano C., Donzaud C., Dornic D., Drouhin D., Dumas A., Eberl T., Elsasser D., Enzenhofer A., Fehn K., Felis I., Fermani P., Flaminio V., Folger F., Fusco L. A., Galata S., Gay P., Geisselsoder S., Geyer K., Giordano V., Gleixner A., Gracia-Ruiz R., Gomez-Gonzalez J. P., Graf K., van Haren H., Heijboer A. J., Hello Yann, Hernandez-Rey J. J., Herrero A., Hossl J., Hofestadt J., Hugon C., James C. W., de Jong M., Kadler M., Kalekin O., Katz U., Kiessling D., Kooijman P., Kouchner A., Kreykenbohm I., Kulikovskiy V., Lahmann R., Lambard G., Lattuada D., Lefevre D., Leonora E., Loucatos S., Mangano S., Marcelin M., Margiotta A., Marinelli A., Martinez-Mora J. A., Martini Séverine, et al. Time calibration with atmospheric muon tracks in the ANTARES neutrino telescope. Astroparticle Physics, 2016, 78, p. 43-51. ISSN 0927-6505

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  10. Adrian-Martinez S., Albert A., Andre M., Anton G., Ardid M., Aubert J. J., Baret B., Barrios-Marti J., Basa S., Bertin V., Biagi S., Bormuth R., Bouwhuis M. C., Bruijn R., Brunner J., Busto J., Capone A., Caramete L., Carr J., Chiarusi T., Circella M., Coniglione R., Costantini H., Coyle P., Creusot A., Dekeyser I., Deschamps A., De Bonis G., Distefano C., Donzaud C., Dornic D., Drouhin D., Dumas A., Eberl T., Elsasser D., Enzenhofer A., Fehn K., Felis I., Fermani P., Folger F., Fusco L. A., Galata S., Gay P., Geisselsoder S., Geyer K., Giordano V., Gleixner A., Gracia-Ruiz R., Graf K., Hallmann S., van Haren H., Heijboer A. J., Hello Yann, et al.. The first combined search for neutrino point-sources in the southern hemisphere with the ANTARES and IceCube neutrino telescopes. Astrophysical Journal, 2016, 823 (1), p. art. 65 [12 p.]. ISSN 0004-637X

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  11. Adrian-Martineza S., Albert A., Andre M., Anton G., Ardid M., Aubert J. J., Avgitas T., Baret B., Barrios-Marti J., Basa S., Bertin V., Biagi S., Bormuth R., Bouwhuis M. C., Bruijn R., Brunner J., Busto J., Capone A., Caramete L., Carr J., Celli S., Chiarusi T., Circella M., Coleiro A., Coniglione R., Costantini H., Coyle P., Creusot A., Deschamps A., De Bonis G., Distefano C., Donzaud C., Dornic D., Drouhin D., Eberl T., El Bojaddaini I., Elsasser D., Enzenhofer A., Fehn K., Felis I., Fusco L. A., Galata S., Gay P., Geisselsoder S., Geyer K., Giordano V., Gleixner A., Glotin H., Gracia-Ruiz R., Graf K., Hallmann S., van Haren H., Heijboer A. J., Hello Yann, et al.. Limits on dark matter annihilation in the sun using the ANTARES neutrino telescope. Physics Letters B, 2016, 759, p. 69-74. ISSN 0370-2693

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  12. Affeldt S., Sokolovska N., Prifti E., Zucker Jean-Daniel. Spectral consensus strategy for accurate reconstruction of large biological networks. BMC Bioinformatics, 2016, 17 (16), p. art. 493 [13 p.]. ISSN 1471-2105

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  13. Afonso C. L., Amarasinghe G. K., Banyai K., Bao Y. M., Basler C. F., Bavari S., Bejerman N., Blasdell K. R., Briand F. X., Briese T., Bukreyev A., Calisher C. H., Chandran K., Cheng J. S., Clawson A. N., Collins P. L., Dietzgen R. G., Dolnik O., Domier L. L., Durrwald R., Dye J. M., Easton A. J., Ebihara H., Farkas S. L., Freitas-Astua J., Formenty P., Fouchier R. A. M., Fu Y. P., Ghedin E., Goodin M. M., Hewson R., Horie M., Hyndman T. H., Jiang D. H., Kitajima E. W., Kobinger G. P., Kondo H., Kurath G., Lamb R. A., Lenardon S., Leroy Eric, Li C. X., Lin X. D., Liu L. J., Longdon B., Marton S., Maisner A., Muhlberger E., Netesov S. V., Nowotny N., Patterson J. L., Payne S. L., Paweska J. T., Randall R. E., Rima B. K., Rota P., Rubbenstroth D., Schwemmle M., Shi M., Smither S. J., Stenglein M. D., Stone D. M., Takada A., Terregino C., Tesh R. B., Tian J. H., Tomonaga K., Tordo N., Towner J. S., Vasilakis N., Verbeek M., Volchkov V. E., Wahl-Jensen V., Walsh J. A., Walker P. J., Wang D., Wang L. F., Wetzel T., Whitfield A. E., Xie J. T., Yuen K. Y., Zhang Y. Z., Kuhn J. H. Taxonomy of the order Mononegavirales : update 2016. Archives of Virology, 2016, 161 (8), p. 2351-2360. ISSN 0304-8608

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  14. Akhil V. P., Lengaigne Matthieu, Durand Fabien, Vialard Jérôme, Chaitanya A. V. S., Keerthi M. G., Gopalakrishna V. V., Boutin J., Montegut C. D. Assessment of seasonal and year-to-year surface salinity signals retrieved from SMOS and Aquarius missions in the Bay of Bengal. International Journal of Remote Sensing, 2016, 37 (5), p. 1089-1114. ISSN 0143-1161

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  15. Akhil V. P., Lengaigne Matthieu, Vialard Jérôme, Durand Fabien, Keerthi M. G., Chaitanya A. V. S., Papa Fabrice, Gopalakrishna V. V., Montegut C. D. A modeling study of processes controlling the Bay of Bengal sea surface salinity interannual variability. Journal of Geophysical Research : Oceans, 2016, 121 (12), p. 8471-8495. ISSN 2169-9275

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  16. Akhtar-Schuster M., Amiraslani F., Morejon C. F. D., Escadafal Richard, Fulajtar E., Grainger A., Kellner K., Khan S. I., Pardo O. P., Sauchanka U., Stringer L. C., Reda F., Thomas R. J. Designing a new science-policy communication mechanism for the UN Convention to Combat Desertification. Environmental Science and Policy, 2016, 63, p. 122-131. ISSN 1462-9011

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  17. Al-Shorbaji F., Roche Benjamin, Gozlan Rodolphe, Britton R., Andreou D. The consequences of reservoir host eradication on disease epidemiology in animal communities. Emerging Microbes and Infections, 2016, 5, p. e46 [12 p.]. ISSN 2222-1751

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  18. Alanoca L., Amouroux D., Monperrus M., Tessier E., Goni M., Guyoneaud R., Acha D., Gassie C., Audry S., Garcia M. E., Quintanilla J., Point David. Diurnal variability and biogeochemical reactivity of mercury species in an extreme high-altitude lake ecosystem of the Bolivian Altiplano. Environmental Science and Pollution Research, 2016, 23 (7), p. 6919-6933. ISSN 0944-1344

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  19. Albuquerque A.L., Meyers P., Belem A.L., Turcq Bruno, Sifeddine Abdelfettah, Mendoza U., Capilla R. Mineral and elemental indicators of post-glacial changes in sediment delivery and deposition under a western boundary upwelling system (Cabo Frio, southeastern Brazil). Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology, 2016, 445, p. 72-82. ISSN 0031-0182

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  20. Ali R.R, Saber M., Nizinski Georges, Montoroi Jean-Pierre, Zaghloul A.M. Land surface analysis of salt affected soils using DEM and GIS. European Journal of Scientific Research, 2016, 138 (2), p. 197-202. ISSN 1450-216X

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  21. Allard P., Aiuppa A., Bani Philipson, Metrich N., Bertagnini A., Gauthier P. J., Shinohara H., Sawyer G., Parello F., Bagnato E., Pelletier Bernard, Garaebiti E. Prodigious emission rates and magma degassing budget of major, trace and radioactive volatile species from Ambrym basaltic volcano, Vanuatu island Arc. In : Vergniolle N. (ed.), Métrich N. (ed.) Understanding volcanoes in the Vanuatu arc. Journal of Volcanology and Geothermal Research, 2016, 322 (No Spécial), p. 119-143. ISSN 0377-0273

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  22. Almar Rafaël, Larnier S., Castelle B., Scott T., Floc'h F. On the use of the Radon transform to estimate longshore currents from video imagery. Coastal Engineering, 2016, 114, p. 301-308. ISSN 0378-3839

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  23. Almeida C., Mourao M. Jr, Dessay Nadine, Lacques A.E., Monteiro A., Durieux Laurent, Venturieri A., Seyler Frédérique. Typologies and spatialization of agricultural production systems in Rondônia, Brazil : linking land use, socioeconomics and territorial configuration. In : Aspinall R. (ed.) Land system science. Land, 2016, 5 (2), art. no 18 [20 p. en ligne] ISSN 2073-445X

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  24. Alout H., Dabiré R. K., Djogbénou L. S., Abate Luc, Corbel Vincent, Chandre Fabrice, Cohuet Anna. Interactive cost of Plasmodium infection and insecticide resistance in the malaria vector Anopheles gambiae. Scientific Reports - Nature, 2016, 6, p. art. 29755 [11 p.]. ISSN 2045-2322

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  25. Alves J.M.B., Vasconcelos F.C.Jr, Chaves R.R., Silva E.M., Servain Jacques, Costa A.A., Sombra S.S., Barbosa A.C.B., Dos Santos A.C.S. Evaluation of the AR4 CMIP3 and the AR5 CMIP5 model and projections for precipitation in northeast Brazil. Frontiers in Earth Science, 2016, 4, art. no 44 [22 p.] ISSN 2296-6463

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  26. André M., Randrianaivo H., Bertaut-Nativel B., Herbreteau Vincent. Spatial investigation of congenital malformations in Reunion Island (2008-2012) [résumé]. In : Rankin J. (ed.) Abstracts from the 13th EUROCAT Scientific Symposium : advancing congenital anomaly research through collaboration. Birth Defects Research Part A : Clinical and Molecular Teratology, 2016, 106 (6), p. 509. EUROCAT Scientific Symposium : Advancing Congenital Anomaly Research Through Collaboration, 13., Milan (ITA), 2016/06/16-17.

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  27. Angelakis E., Bachar D., Henrissat B., Armougom Fabrice, Audoly G., Lagier J. C., Robert C., Raoult Didier. Glycans affect DNA extraction and induce substantial differences in gut metagenomic studies. Scientific Reports - Nature, 2016, 6, p. art. 26276 [8 p.]. ISSN 2045-2322

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  28. Ansel J. L., Moretti Christian, Raharivelomanana P., Hano C. Cosmetopoeia : foreword. Comptes Rendus Chimie, 2016, 19 (9), p. 1033-1034. ISSN 1631-0748

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  29. Aouade G., Ezzahar J., Amenzou N., Er-Raki S., Benkaddour A., Khabba S., Jarlan Lionel. Combining stable isotopes, Eddy Covariance system and meteorological measurements for partitioning evapotranspiration, of winter wheat, into soil evaporation and plant transpiration in a semi-arid region. Agricultural Water Management, 2016, 177, p. 181-192. ISSN 0378-3774

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  30. Apaire-Marchais V., Ogliastro M., Chandre Fabrice, Pennetier Cédric, Raymond V., Lapied B. Virus and calcium : an unexpected tandem to optimize insecticide efficacy. Environmental Microbiology Reports, 2016, 8 (2), p. 168-178. ISSN 1758-2229

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  31. Armougom Fabrice, Bitam I., Croce O., Merhej V., Barassi L., Nguyen T. T., La Scola B., Raoult Didier. Insights into a new Citrobacter koseri strain revealed gene exchanges with the virulence-associated Yersinia pestis ppcp1 plasmid. Frontiers in Microbiology, 2016, 7, p. art. 340 [13 p.]. ISSN 1664-302X

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  32. Arnal A., Tissot T., Ujvari B., Nunney L., Solary E., Laplane L., Bonhomme F., Vittecoq M., Tasiemski A., Renaud F., Pujol P., Roche Benjamin, Thomas F. The guardians of inherited oncogenic vulnerabilities. Evolution, 2016, 70 (1), p. 1-6. ISSN 0014-3820

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010066102 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  33. Arrigoni R., Benzoni F., Terraneo T. I., Caragnano Annalisa, Berumen M. L. Recent origin and semi-permeable species boundaries in the scleractinian coral genus Stylophora from the Red Sea. Scientific Reports - Nature, 2016, 6, p. art. 34612 [13 p.]. ISSN 2045-2322

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  34. Assassi C., Morel Yves, Vandermeirsch F., Chaigneau Alexis, Pegliasco C., Morrow R., Colas François, Fleury S., Carton X., Klein P., Cambra R. An index to distinguish surface- and subsurface-intensified vortices from surface observations. Journal of Physical Oceanography, 2016, 46 (8), p. 2529-2552. ISSN 0022-3670

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  35. Aubertin Catherine, Couvet D., Flipo F. Une "marchandisation de la nature" ? : de l'intégration de la nature en économie. Revue du MAUSS Permanente, 2016, 9 février, 7 p. [en ligne]

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  36. Aubertin Catherine. Politiques forestières en Amazonie brésilienne : du REDD au code forestier. Revue Tiers Monde, 2016, 226-227, p. 9-36. ISSN 1293-8882

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  37. Auria Richard, Boileau Céline, Davidson Sylvain, Casalot Laurence, Christen Pierre, Liebgott P. P., Combet-Blanc Yannick. Hydrogen production by the hyperthermophilic bacterium Thermotoga maritima Part II : modeling and experimental approaches for hydrogen production. Biotechnology for Biofuels, 2016, 9, p. art. 268 [14 p.]. ISSN 1754-6834

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010068795 Lien chez l'éditeur Fichier au format PDF

  38. Ayar P. V., Vrac M., Bastin S., Carreau Julie, Deque M., Gallardo C. Intercomparison of statistical and dynamical downscaling models under the EURO- and MED-CORDEX initiative framework : present climate evaluations. Climate Dynamics, 2016, 46 (3-4), p. 1301-1329. ISSN 0930-7575

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010066201 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  39. Ayouba Ahidjo, Paraskevis D., Peeters Martine. Editorial : Special issue "Evolution of HIV". Infection Genetics and Evolution, 2016, 46, p. 149-149. ISSN 1567-1348

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010068806 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  40. Azam M. F., Ramanathan A., Wagnon Patrick, Vincent C., Linda A., Berthier E., Sharma P., Mandal A., Angchuk T., Singh V. B., Pottakkal J. G. Meteorological conditions, seasonal and annual mass balances of Chhota Shigri Glacier, western Himalaya, India. Annals of Glaciology, 2016, 57 (71), p. 328-338. ISSN 0260-3055

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  41. Ba K., Thiaw M., Lazar N., Sarr A., Brochier Timothée, Ndiaye I., Faye A., Sadio Oumar, Panfili Jacques, Thiaw O. T., Brehmer Patrice. Resilience of key biological parameters of the Senegalese flat sardinella to overfishing and climate change. Plos One, 2016, 11 (6), p. e0156143 [20 p.]. ISSN 1932-6203

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  42. Bacaër Nicolas. Le modèle stochastique SIS pour une épidémie dans un environnement aléatoire. Journal of Mathematical Biology, 2016, 73 (4), p. 847-866. ISSN 0303-6812

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010068171 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  43. Bachelery M. L., Illig Serena, Dadou I. Interannual variability in the South-East Atlantic Ocean, focusing on the Benguela Upwelling System : remote versus local forcing. Journal of Geophysical Research : Oceans, 2016, 121 (1), p. 284-310. ISSN 2169-9275

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  44. Bandje K., Naissant B., Bigey P., Lohezic M., Vayssieres M., Blaud M., Kermasson L., Lopez-Rubio J. J., Langsley G., Lavazec C., Deloron Philippe, Merckx A. Characterization of an A-kinase anchoring protein-like suggests an alternative way of PKA anchoring in Plasmodium falciparum. Malaria Journal, 2016, 15, p. art. 248 [13 p.]. ISSN 1475-2875

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010066849 Lien chez l'éditeur Fichier au format PDF

  45. Barak J. D., Vancheva T., Lefeuvre P., Jones J. B., Timilsina S., Minsavage G. V., Vallad G. E., Koebnik Ralf. Whole-genome sequences of Xanthomonas euvesicatoria strains clarify taxonomy and reveal a stepwise erosion of type 3 effectors. Frontiers in Plant Science, 2016, 7, p. art. 1805 [12 p.]. ISSN 1664-462X

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  46. Barankanira Emmanuel, Molinari N., Niyongabo T., Laurent Christian. Spatial analysis of HIV infection and associated individual characteristics in Burundi : indications for effective prevention. BMC Public Health, 2016, 16, p. art. 118 [11 p.]. ISSN 1471-2458

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