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Publications des scientifiques de l'IRD

2013 - Sciences du monde végétal et animal

  1. Abbas Y., Yakhlef S.E.B., Prin Y., Arahou M., Abourouh M., Duponnois Robin. Croissance et nutrition du thuya de Berbérie (Tetraclinis articulata [Vahl] Mast.) mis en culture dans différents sols rhizosphériques de peuplement de thuya. Biotechnologie, Agronomie, Société et Environnement, 2013, 17 (1), p. 3-11. ISSN 1370-6233

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  2. Abbott R., Albach D., Ansell S., Arntzen J. W., Baird S. J. E., Bierne N., Boughman J., Brelsford A., Buerkle C. A., Buggs R., Butlin R. K., Dieckmann U., Eroukhmanoff F., Grill A., Cahan S. H., Hermansen J. S., Hewitt G., Hudson A. G., Jiggins C., Jones J., Keller B., Marczewski T., Mallet Julien, Martinez-Rodriguez P., Most M., Mullen S., Nichols R., Nolte A. W., Parisod C., Pfennig K., Rice A. M., Ritchie M. G., Seifert B., Smadja C. M., Stelkens R., Szymura J. M., Vainola R., Wolf J. B. W., Zinner D. Hybridization and speciation. Journal of Evolutionary Biology, 2013, 26 (2), p. 229-246. ISSN 1010-061X

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  3. Abdel-Lateif K., Vaissayre Virginie, Gherbi Hassen, Verries C., Meudec E., Perrine-Walker F., Cheynier V., Svistoonoff Sergio, Franche Claudine, Bogusz Didier, Hocher Valérie. Silencing of the chalcone synthase gene in Casuarina glauca highlights the important role of flavonoids during nodulation. New Phytologist, 2013, 199 (4), p. 1012-1021. ISSN 1469-8137

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  4. Abdeljabbar H., Cayol J. L., Ben Hania Wajdi, Boudabous A., Sadfi N., Fardeau Marie-Laure. Halanaerobium sehlinense sp. nov., an extremely halophilic, fermentative, strictly anaerobic bacterium from sediments of the hypersaline lake Sehline Sebkha. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2013, 63 (6), p. 2069-2074. ISSN 1466-5026

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  5. Abril G., Deborde J., Savoye N., Mathieu F., Moreira Turcq Patricia, Artigas F., Meziane T., Takiyama L. R., de Souza M. S., Seyler Patrick. Export of C-13-depleted dissolved inorganic carbon from a tidal forest bordering the Amazon estuary. Estuarine Coastal and Shelf Science, 2013, 129, p. 23-27. ISSN 0272-7714

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  6. Adakal H., Biguezoton A., Zoungrana S., Courtin Fabrice, De Clercq E. M., Madder M. Alarming spread of the Asian cattle tick Rhipicephalus microplus in West Africa-another three countries are affected : Burkina Faso, Mali and Togo. Experimental and Applied Acarology, 2013, 61 (3), p. 383-386. ISSN 0168-8162

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  7. Addou A. N., Schumann P., Sproer C., Bouanane-Darenfed A., Amarouche-Yala S., Hacene H., Cayoll J. L., Fardeau Marie-Laure. Melghirimyces thermohalophilus sp nov., a thermoactinomycete isolated from an Algerian salt lake. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2013, 63 (5), p. 1717-1722. ISSN 1466-5026

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  8. Adjeroud Mehdi, Briand M.J., Kayal Mohsen, Dumas Pascal. Coral assemblages in Tonga : spatial patterns, replenishment capacities, and implications for conservation strategies. Environmental Monitoring and Assessment, 2013, 185 (7), p. 5763-5773. ISSN 0167-6369

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  9. Aholoukpe H., Dubos B., Flori A., Deleporte P., Amadji G., Chotte Jean-Luc, Blavet Didier. Estimating aboveground biomass of oil palm : allometric equations for estimating frond biomass. Forest Ecology and Management, 2013, 292, p. 122-129. ISSN 0378-1127

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  10. Al-Tam F., Adam Hélène, dos Anjos A., Lorieux Mathias, Larmande Pierre, Ghesquière Alain, Jouannic Stefan, Shahbazkia H. R. P-TRAP : a panicle trait phenotyping tool. Bmc Plant Biology, 2013, 13, p. 122. ISSN 1471-2229

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  11. Albouy C., Guilhaumon François, Leprieur F., Lasram F. B., Somot S., Aznar R., Velez Laure, Le Loc'h François, Mouillot D. Projected climate change and the changing biogeography of coastal Mediterranean fishes. Journal of Biogeography, 2013, 40 (3), p. 534-547. ISSN 0305-0270

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  12. Allouis T., Durrieu S., Vega C., Couteron Pierre. Stem volume and above-ground biomass estimation of individual pine trees from LiDAR data : contribution of full-waveform signals. IEEE Journal of Selected Topics in Applied Earth Observations and Remote Sensing, 2013, 6 (3), p. 924-934. ISSN 1939-1404

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  13. Almeida J. P., Montufar R., Anthelme Fabien. Patterns and origin of intraspecific functional variability in a tropical alpine species along an altitudinal gradient. Plant Ecology and Diversity, 2013, 6 (3-4), p. 423-433. ISSN 1755-0874

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  14. Amborella Genome Project, Kochko Alexandre de (collab.), Poncet Valérie (collab.). The Amborella genome and the evolution of flowering plants. Science, 2013, 342 (6165), p. 1467 + 1241089.1-1241089.10 [en ligne]. ISSN 0036-8075

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  15. Amenzou N., Marah H., Raibi F., Ezzahar S., Khabba S., Jarlan Lionel, Ismaili M. Estimation of soil evaporation and infiltration losses using stables isotopes, fluxmeter and eddy-covariance system for citrus orchards in a semi-arid region (Morocco). Academia Journal of Environmental Sciences, 2013, 1 (1), p. 001-008. ISSN 2315-778X

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  16. Amossé J., Bettarel Y., Bouvier C., Bouvier T., Toan Tran Duc, Thuy Doan Thu, Jouquet Pascal. The flow of nitrogen, bacteria and viruses from the soil to water compartments are influenced by earthworm activity and organic fertilization (compost vs. vermicompost). Soil Biology and Biochemistry, 2013, 66, p. 197-203. ISSN 0038-0717

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  17. Amziane M., Metiaz F., Darenfed-Bouanane A., Djenane Z., Selama O., Abderrahmani A., Cayol J. L., Fardeau Marie-Laure. Virgibacillus natechei sp nov., a moderately halophilic bacterium isolated from sediment of a saline lake in southwest of Algeria. Current Microbiology, 2013, 66 (5), p. 462-466. ISSN 0343-8651

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  18. Andargie M., Pasquet Rémy, Muluvi G. M., Timko M. P. Quantitative trait loci analysis of flowering time related traits identified in recombinant inbred lines of cowpea (Vigna unguiculata). Genome, 2013, 56 (5), p. 289-294. ISSN 0831-2796

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  19. Andriamihaja D.J. Détermination de la capacité de nodulation de quelques lignées du haricot : cas du Moyen Ouest de Madagascar. Antsirabe : ASJA, 2013, 37 p. multigr. + 7 p. d'annexes Mém. Master 2 : Sci. Agron. : Développement Agr. et Rural, Université Privée Athénée Saint Joseph : Antsirabe.

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  20. Andrianaivoarimanana V., Kreppel K., Elissa N., Duplantier Jean-Marc, Carniel E., Rajerison M., Jambou R. Understanding the persistence of plague foci in Madagascar. Plos Neglected Tropical Diseases, 2013, 7 (11), p. e2382. ISSN 1935-2735

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  21. Andrianasolo D. N., Davis A. P., Razafinarivo N. J., Hamon Serge, Rakotomalala J. J., Sabatier S. A., Hamon Perla. High genetic diversity of in situ and ex situ populations of Madagascan coffee species : further implications for the management of coffee genetic resources. Tree Genetics and Genomes, 2013, 9 (5), p. 1295-1312. ISSN 1614-2942

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  22. Antin C., Pélissier Raphaël, Vincent Grégoire, Couteron Pierre. Crown allometries are less responsive than stem allometry to tree size and habitat variations in an Indian monsoon forest. Trees : Structure and Function, 2013, 27 (5), p. 1485-1495. ISSN 0931-1890

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  23. Antoine P. O., Roddaz M., Brichau Stéphanie, Tejada-Lara J., Salas-Gismondi R., Altamirano A., Louterbach M., Lambs L., Otto T., Brusset S. Middle Miocene vertebrates from the Amazonian Madre de Dios subandean zone, Peru. Journal of South American Earth Sciences, 2013, 42, p. 91-102. ISSN 0895-9811

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  24. Arlyza I. S., Shen K. N., Durand Jean-Dominique, Borsa Philippe. Mitochondrial haplotypes indicate parapatric-like phylogeographic structure in blue-spotted maskray (Neotrygon kuhlii) from the Coral Triangle Region. Journal of Heredity, 2013, 104 (5), p. 725-733. ISSN 0022-1503

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  25. Arrieta-Ortiz M. L., Rodriguez L. M., Perez-Quintero A. L., Poulin Lucie, Diaz A. C., Arias Rojas N., Trujillo C., Restrepo Benavides M., Bart R., Boch J., Boureau T., Darrasse A., David P., Dugué de Bernonville T., Fontanilla P., Gagnevin L., Guérin F., Jacques M. A., Lauber E., Lefeuvre P., Medina C., Medina E., Montenegro N., Munoz Bodnar A., Noel L. D., Ortiz Quinones J. F., Osorio D., Pardo C., Patil P. B., Poussier S., Pruvost O., Robène-Soustrade I., Ryan R. P., Tabima J., Urrego Morales O. G., Vernière C., Carrere S., Verdier Valérie, Szurek Boris, Restrepo S., Lopez C., Koebnik Ralf, Bernal A. Genomic survey of pathogenicity determinants and VNTR markers in the cassava bacterial pathogen Xanthomonas axonopodis pv. manihotis strain cio151. Plos One, 2013, 8 (11), p. e79704. ISSN 1932-6203

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  26. Arrighi Jean-François, Cartieaux Fabienne, Chaintreuil Clémence, Brown S., Boursot Marc, Giraud Eric. Genotype delimitation in the nod-idependent model legume Aeschynomene evenia. Plos One, 2013, 8 (5), p. e6386. ISSN 1932-6203

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  27. Ash G. J., Lang J. M., Triplett L. R., Stodart B. J., Verdier Valérie, Leach J. E. Loop-mediated isothermal amplification for the detection of Pseudomonas fuscovaginae. Phytopathology, 2013, 103 (6 suppl. 2), p. 10-10. ISSN 0031-949X

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  28. Assoumane A., Zoubeirou A. M., Rodier-Goud M., Favreau B., Bezançon Gilles, Verhaegen D. Highlighting the occurrence of tetraploidy in Acacia senegal (L.) Willd. and genetic variation patterns in its natural range revealed by DNA microsatellite markers. Tree Genetics and Genomes, 2013, 9 (1), p. 93-106. ISSN 1614-2942

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  29. Aubertin Catherine. O surgimento do bioma cerrado. Ateliê Geografico, 2013, 7 (1), p. 05-24. ISSN 1982-1956

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  30. Aubin J.P., Chen L., Durand Marie-Hélène. Dynamic decentralization of harvesting constraints in the management of tychastic evolution of renewable resources. Computational Management Science, 2013, 10 (4), p. 281-298. ISSN 1619-697X

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  31. Auclair Laurent, Dominguez P., Alifriqui M., Genin Didier. Un monument pastoral à l'épreuve de la patrimonialisation : l'Agdal du Yagour dans le Haut-Atlas marocain. In : Juhé Beaulaton D. (ed.), Cormier Salem Marie-Christine (ed.), Robert Pascale de (ed.), Roussel B. (ed.) Effervescence patrimoniale au Sud : entre nature et société. Marseille : IRD, 2013, p. 105-128. (Latitudes 23). ISBN 2-7099-1747-6

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  32. Auclair Laurent, Simenel Romain. Quand le forestier endosse les habits du saint ... La gestion des frontières communautaires dans le Haut Atlas et l'arganeraie (Maroc). In : Aubert P.M. (ed.), Sabir M. (ed.) Enjeux de la gestion des forêts au Maroc : dossier. Revue Forestière Française, 2013, 65 (4), p. 341-357. ISSN 1951-6827

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  33. Auguy Florence, Fahr M., Moulin Esmard Patricia, Brugel A., Laplaze Laurent, El Mzibri M., Filali-Maltouf A., Doumas P., Smouni A. Lead tolerance and accumulation in Hirschfeldia incana, a Mediterranean Brassicaceae from metalliferous mine spoils. Plos One, 2013, 8 (5), p. e61932. ISSN 1932-6203

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  34. Aullo T., Ranchou-Peyruse A., Ollivier Bernard, Magot M. Desulfotomaculum spp. and related gram-positive sulfate-reducing bacteria in deep subsurface environments. Frontiers in Microbiology, 2013, 4, 362 [12 p. en ligne] ISSN 1664-302X

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  35. Ayouba Ahidjo, Duval L., Liégeois Florian, Ngin S., Ahuka-Mundeke S., Switzer W. M., Delaporte Eric, Ariey F., Peeters Martine, Nerrienet E. Nonhuman primate retroviruses from Cambodia : high simian foamy virus prevalence, identification of divergent STLV-1 strains and no evidence of SIV infection. Infection Genetics and Evolution, 2013, 18, p. 325-334. ISSN 1567-1348

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  36. Ba Khalilou, Kane Mamadou, Gauthier Philippe, Granjon Laurent. Ecology of a typical West African Sudanian savannah rodent community. African Journal of Ecology, 2013, 51 (3), p. 447-455. ISSN 0141-6707

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  37. Bacaër Nicolas, Khaladi M. On the basic reproduction number in a random environment. Journal of Mathematical Biology, 2013, 67 (6-7), p. 1729-1739. ISSN 0303-6812

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  38. Baker R., Bragard C., Candresse T., Gauthier Nathalie, et al., EFSA Panel on Plant Health. Scientific opinion on the risks to plant health posed by Bemisia tabaci species complex and iruses it transmits for EU territory. EFSA Journal, 2013, 11 (4), art. no 3162 [302 p.] ISSN 1831-4732

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  39. Baker W. J., Couvreur Thomas. Global biogeography and diversification of palms sheds light on the evolution of tropical lineages. I. Historical biogeography. Journal of Biogeography, 2013, 40 (2), p. 274-285. ISSN 0305-0270

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  40. Baker W. J., Couvreur Thomas. Global biogeography and diversification of palms sheds light on the evolution of tropical lineages. II. Diversification history and origin of regional assemblages. Journal of Biogeography, 2013, 40 (2), p. 286-298. ISSN 0305-0270

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010058951 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  41. Balde M. C., Chippaux Jean-Philippe, Boiro M. Y., Stock R. P., Massougbodji A. Use of antivenoms for the treatment of envenomation by Elapidae snakes in Guinea, Sub-Saharan Africa. Journal of Venomous Animals and Toxins Including Tropical Diseases, 2013, 19, ISSN 1678-9199

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010060464 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  42. Balique F., Colson P., Barry A. O., Nappez C., Ferretti A., Al Moussawi K., Ngounga T., Lepidi H., Ghigo E., Mege J. L., Lecoq H., Raoult Didier. Tobacco Mosaic Virus in the lungs of mice following intra-tracheal inoculation. Plos One, 2013, 8 (1), p. e54993. ISSN 1932-6203

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  43. Ballardini M., Mercuri A., Littardi C., Abbas S., Couderc Marie, Ludena B., Pintaud Jean-Christophe. The chloroplast DNA locus psbZ-trnfM as a potential barcode marker in Phoenix L. (Arecaceae). Zookeys, 2013, (365), p. 71-82. ISSN 1313-2989

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  44. Bally René, Duponnois Robin. La Grande Muraille verte. Pour la Science, 2013, (434), p. 62-68. ISSN 0153-4092

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010060204 Accès réservé (Intranet IRD)

  45. Banuls Anne-Laure, Thomas F., Renaud F. Of parasites and men. Infection Genetics and Evolution, 2013, 20, p. 61-70. ISSN 1567-1348

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010061370 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  46. Baret S., Baider C., Kueffer C., Foxcroft L.C., Lagabrielle Erwann. Threats to paradise ? Plant Invasions in protected areas of the Western Indian Ocean islands. In : Foxcroft L.C. (ed.), Pysek P. (ed.), Richardson D.M. (ed.), Genovesi P. (ed.) Plant invasions in protected areas : patterns, problems and challenges. Berlin : Springer, 2013, (7), p. 423-447. (Invading Nature-Springer Series in Invasion Ecology ; 7). ISSN 1874-7809

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  47. Barnaud Adeline, Kalwij J. M., McGeoch M. A., van Vuuren B. J. Patterns of weed invasion : evidence from the spatial genetic structure of Raphanus raphanistrum. Biological Invasions, 2013, 15 (11), p. 2455-2465. ISSN 1387-3547

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  48. Baronti Cécile, Pastorino B., Charrel R., De Lamballerie Xavier. Mycoplasma removal : simple curative methods for viral supernatants. Journal of Virological Methods, 2013, 187 (2), p. 234-237. ISSN 0166-0934

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010059023 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  49. Baroux C., Autran Daphné, Raissig M. T., Grimanelli Daniel, Grossniklaus U. Parental contributions to the transcriptome of early plant embryos. Current Opinion in Genetics and Development, 2013, 23 (1), p. 72-74. ISSN 0959-437X

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010060828 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  50. Barrabé Laure, Mouly A., Florence Jacques. Psychotriae (Rubiaceae) neocaledonicarum specierum nomenclator. Adansonia, 2013, 35 (2), p. 281-357. ISSN 1280-8571

    http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010064622 Lien chez l'éditeur Accès réservé (Intranet IRD)

  51. Barraco G., Sylvestre Isabelle, Iapichino G., Engelmann Florent. Investigating the cryopreservation of nodal explants of Lithodora rosmarinifolia (Ten.) Johnst., a rare, endemic Mediterranean species. Plant Biotechnology Reports, 2013, 7 (2), p. 141-146. ISSN 1863-5466

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  52. Barrault J., Ritzenthaler I. (ill.), Gâteblé G. (collab.), Baillon N. (collab.), Saintpierre D. (collab.), Hénocque S. (collab.), Jourdan Hervé (collab.), Vandrot Hervé (collab.), Héquet Vanessa (collab.), Cousinard G. (collab.), Le Breton J. (collab.), Cabalion P. (collab.), Papineau C. (collab.), Salesne T. (collab.), MilleC. (collab.), Brescia F. (collab.), Duval T. (collab.), Gailhbaud P. (collab.), Géraux H. (collab.), Lorenzo P. (collab.), Montagnat V. (collab.), Buisson D. (collab.) La forêt sèche. Nouméa : CIE, 2013, 33 p. (CIE - Milieux Naturels).

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  53. Barsalobres-Cavallari C.F., Petitot Anne-Sophie, Severino F.E., Maia I.G., Fernandez Diana. Host response profiling to fungal infection: molecular cloning, characterization and expression analysis of NPR1 gene from coffee (Coffea arabica). In : Mendez-Vilas A. (ed.) Microbial pathogens and strategies for combating them : science, technology and education. Badajoz : Formatex Research Center, 2013, (4), p. 411-418. (Microbiology ; 4). ISBN 978-84-939843-9-7

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  54. Baufume Servane, Meynard D., Reschke M., Sole M., Cunnac Sébastien, Szurek Boris, Guiderdoni E., Boch J., Koebnik Ralf. New rice resistance genes via targeted genome editing. Phytopathology, 2013, 103 (6 suppl. 2), p. 13-13. ISSN 0031-949X

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